Chia sẻ bài báo qua Email PHÂN TÍCH MỘT SỐ VÙNG GENE VÀ ĐỀ XUẤT ỨNG VIÊN MÃ VẠCH DNA CỦA CÂY VÚ BÒ (Ficus simplicissima Lour.)
Thông tin bài báo
Ngày nhận bài: 06/04/24 Ngày hoàn thiện: 20/05/24 Ngày đăng: 20/05/24Các tác giả
1. Phạm Thị Thu Hiền
, Trường Đại học Sư phạm - ĐH Thái Nguyên2. Vũ Thị Thu Thuỷ, Trường Đại học Sư phạm - ĐH Thái Nguyên
3. Chu Hoàng Mậu, Trường Đại học Sư phạm - ĐH Thái Nguyên
Tóm tắt
Cây Vú bò (Ficus simplicissima Lour.), một loài dược liệu quý được sử dụng để điều trị một số bệnh và thúc đẩy tiết sữa ở người. Loài Vú bò có hình thái tương tự với một số loài thuộc chi Ficus, hoặc mẫu cây bị biến dạng hay ở dạng bột thì rất khó nhận diện. Mục đích của nghiên cứu này là lựa chọn vùng gene trong hệ gene lục lạp làm chỉ thị DNA để hỗ trợ định danh loài Vú bò (F. simplicissima). Sử dụng hệ gene lục lạp của loài Ficus hista làm tham chiếu và các phần mềm BioEdit, BLAST và MEGA11 trong nhận diện các vùng gene đích và phân tích sự phát sinh chủng loại. Kết quả đã xác định được trình tự nucleotide của bốn vùng gene matK, ndhF, trnL-UAA và rrs23 tương ứng với các kích thước là 1519 bp, 2261 bp, 592 bp và 2810 bp. Phân tích tiến hoá phân tử, dựa trên dữ liệu các vùng gene đã xác định, bốn cây phát sinh chủng loại đã được thiết lập. Vùng gene matK và ndhF của loài Vú bò (F. simplicissima) có quan hệ rất gần với hai loài Ficus carica và Ficus hista, hệ số bootstrap 100% được đề xuất làm ứng cử viên mã vạch DNA hỗ trợ định danh loài Vú bò (F. simplicissima).
Từ khóa
Toàn văn:
PDFTài liệu tham khảo
[1] eFloras, “Chinese Plant Names: Ficus Linn.,” 2003. [Online]. Available: http://www.efloras.org/florataxon.aspx?flora_id=3&taxon_id=112770. [Accessed Jan. 15, 2024].
[2] D. T. Au, H. Chen, Z. Jiang, and Z. Zhao, “A novel method to identify the Chinese herbal medicine Wuzhimaotao by quantification of laticifers,” Micros Res. Techn., vol. 72, pp. 293-298, 2009, doi: 10.1002/jemt.20650.
[3] N. T. T. Nguyen, H. T. T. Pho, Q. H. Nguyen, N. T. Doan, L. T. N. Nguyen, H. M. Pham, T. L. Le, T. D. Sy, H. H. Chu, L. T. K. Vu, and M. H. Chu, “Characteristics of the Chloroplast Genome of Adinandra boockiana and Comparative Analysis with Species of Pentaphylacaceae Family,” Plant Mol Biol Rep., vol. 41, pp. 611-621, 2023, doi: 10.1007/s11105-023-01389-3.
[4] H. Q. Nguyen, T. N. L. Nguyen, T. N. Doan, T. T. N. Nguyen, M. H. Phạm, T. L. Le, D. T. Sy, H. H. Chu, and H. M. Chu, “Complete chloroplast genome of novel Adinandra megaphylla Hu species: molecular structure, comparative and phylogenetic analysis,” Sci Rep., vol. 11, 2021, Art. no. 11731, doi: 10.1038/s41598-021-91071-z.
[5] T. T. T Vu, V. Xyphanboun, T. H. Tran, T. T. N. Nguyen, T. M. T. Lo, and H. M. Chu, “Characteristics of the morphology, anatomy and matK gene region of Cassia fistula (L.) plants,” TNU Journal of Science and Technology, vol. 229, no. 05, pp. 259-266, 2024, doi: 10.34238/tnu-jst.9291.
[6] T. T. H. Pho, T. T. N. Nguyen, H. Q. Nguyen, D, T. Sy, and H. M. Chu, “Morphological, anatomical, and the rbcL gene sequence characteristics of Adinandra glischromola,” TNU Journal of Science and Technology, vol. 228, no. 13, pp. 289-297, 2023, doi: 10.34238/tnu-jst.8344.
[7] T. T. T. Vu, “Ficus simplicissima chloroplast sequence,” GenBank: OP928145.1., 2023. [Online] Available: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/OP928145. [Accessed Jan. 15, 2024].
[8] T. T. T. Vu, L. T. K. Vu, L. T. Le, T. T. M. Lo, and M. H. Chu, “Analysis of the chloroplast genome of Ficus simplicissima Lour collected in Vietnam and proposed barcodes for identifying Ficus plants,” Curr. Issues Mol. Biol., vol.45, pp. 1024-1036, 2023, doi: 10.3390/cimb45020067.
[9] Y. C. Shi, “Ficus hirta chloroplast, complete genome,” NCBI Reference Sequence: NC_051532.1, 2023. [Online]. Available: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_051532.1. [Accessed Jan. 15, 2024].
[10] K. Tamura, G. Stecher, and S. Kumar, “MEGA11: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 11,” Mol Biol Evol., vol. 38, pp. 3022-3027, 2021, doi: 10.1093/molbev/msab120.
[11] K. Tamura and M. Nei, “Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees,” Mol Biol Evol., vol. 10, pp. 512-26, 1993, doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040023.
[12] J. Felsenstein, “Confidence limits on phylogenies: an approach using the bootstrap,” Evolution, vol. 39, pp. 783-791, 1985, doi: 10.1111/j.1558-5646.1985.tb00420.x.
[13] National Center for Biotechnology Information, “GenBank”. [Online]. Available: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore. [Accessed Jan. 15, 2024].DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.10047
Các bài báo tham chiếu
- Hiện tại không có bài báo tham chiếu