ĐỊNH DANH VÀ ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA LOÀI TRAI LÝ (Garcinia fagraeoides) THU THẬP TẠI THÁI NGUYÊN DỰA TRÊN CHỈ THỊ DNA

Dương Văn Đoàn; Hoàng Văn Hùng; Ngô Thị Hiền; Nguyễn Thanh Hằng; Lã Văn Hiền; Dương Văn Cường

doi:10.34238/tnu-jst.10486

ĐỊNH DANH VÀ ĐÁNH GIÁ ĐA DẠNG DI TRUYỀN CỦA LOÀI TRAI LÝ (Garcinia fagraeoides) THU THẬP TẠI THÁI NGUYÊN DỰA TRÊN CHỈ THỊ DNA

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 29/05/24 Ngày hoàn thiện: 11/07/24 Ngày đăng: 17/07/24

Các tác giả

1. Dương Văn Đoàn, Trường Đại học Nông Lâm – ĐH Thái Nguyên
2. Hoàng Văn Hùng , Đại học Thái Nguyên
3. Ngô Thị Hiền, Trường Đại học Nông Lâm – ĐH Thái Nguyên
4. Nguyễn Thanh Hằng, Trường Đại học Nông Lâm – ĐH Thái Nguyên
5. Lã Văn Hiền, Trường Đại học Nông Lâm – ĐH Thái Nguyên
6. Dương Văn Cường, Trường Đại học Nông Lâm – ĐH Thái Nguyên

Tóm tắt

Trai lý là một loại cây gỗ lớn thuộc họ Măng cụt (Clusiaceae), có giá trị kinh tế và thương mại, đang bị khai thác một cách không kiểm soát, dẫn đến nguy cơ bị tuyệt chủng. Tại Việt Nam, các nghiên cứu về Trai lý chủ yếu tập trung vào việc phân loại dựa trên các đặc điểm hình thái bên ngoài. Nhờ sự tiến bộ trong lĩnh vực sinh học phân tử, các nghiên cứu về đa dạng di truyền đã được tiến hành ở mức độ phân tử, kết hợp với các đặc điểm hình thái của cây. Trong nghiên cứu này, ba vùng gene matK, rbcL và ITS2 đã được khuếch đại, giải trình tự và xác định loài. Ngoài ra, các chỉ thị microsatellite cũng đã được sử dụng để đánh giá đa dạng di truyền nhằm mục đích bảo tồn nguồn gene. Kết quả từ việc xác định và đánh giá đa dạng di truyền cho thấy rằng đối tượng nghiên cứu thuộc chi Garcinia, họ Clusiaceae. Tên khoa học đã được đăng ký trên NCBI là Garcinia fagraeoides. Ngoài ra, các mồi SSR/ISSR đã chỉ ra được tính đa hình giữa các mẫu nghiên cứu. Những kết quả nghiên cứu này đã cung cấp cơ sở khoa học để lựa chọn những cây trội phục vụ công tác bảo tồn nguồn gene này.

Từ khóa

Garcinia fagraeoides; Đa dạng di truyền; Định danh; matK, rbcL và ITS2; Sinh học phân tử

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

[1] B. L. S. D. E. Santo, L. F. Santana, W. H. K. Junior, F. D. O. D. Araújo, D. Bogo, K. D. C. Freitas, R. D. C. A. Guimarães, P. A. Hiane, A. Pott, W. F. D. O. Filiú, M. A. Asato, P. D. O. Figueiredo, and P. R. H. D. O. Bastos, “Medicinal Potential of Garcinia Species and Their Compounds,” Molecules (Basel, Swtizerland), vol. 5, no. 19, 2020, Art. no. 4513.

[2] I. Sordat-Diserens, B. S. C. Rogers, and K. Hostettmann, “Prenylated xanthones from Garcinia livingstonei,” Phytochemistry, vol. 31, no. 1, pp. 313-316, 1992.

[3] S. A. Khanum, S. Shashikanth, and A. V. Deepak, “Synthesis and anti-inflammatory activity of benzophenone analogues,” Bioorg chem, vol. 32, nol. 4, pp. 211-222, 2004.

[4] D. Diaz-Carballo, S. Seeber, D. Strumberg, and R. A. Hilger, “Novel antitumoral compound isolated from Clusia rosea,” International Journal of Clinical Pharmacology and Therapeutics, vol. 41, no. 12, pp. 622-623, 2003.

[5] U. M. Acuna, K. Dastmalch, M. J. Basil, and E. J. Kennelly, “Quantitative high-performance liquid chromatography photo-diode array (HPLC-PDA) analysis of benzophenones and biflavonoids in eight Garcinia species,” Journal of Food Composition and Analysis, vol. 25, no. 2, pp. 215-220, 2012.

[6] V. D. Duong, T. H. Ngo, T. H. Pham, S. H. Le, and V. T. Nguyen, “Application of stress wave technology for predicting quality of Garcinia fagraeodies wood in Vo Nhai district, Thai Nguyen province,” Journal of Forestry Science and Technology, vol. 13, no. 2, pp. 104-111, 2024.

[7] CBOL Plant Working Group, P. M. Hollingsworth, L. L. Forrest, J. L. Spouge, M. Hajibabaei, and S. Ratnasingham, “A DNA barcode for land plants,” Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 106, no. 31, pp. 12794-12797, 2009.

[8] T. L. Tran, T. T. H. Vu, T. L. Nguyen, and T. P. Dinh, “Comparison of the effectiveness of ISSR and SSR markers in assessing the genetic diversity of natural populations of Dacrydium elatum in the Central Highlands of Vietnam,” Journal of Biotechnology, vol. 15, no. 2, pp. 293-305, 2017.

[9] W. J. Kress and D. L. Erickson, “DNA barcodes: genes, geneomics, and bioinformatics,” Proceedings of the National Academy of Sciences, vol. 105, no. 8, pp. 2761-2762, 2008.

[10] K. V. Ravishanahr, R. Vasudeva, B. Hemanth, P. Nischita, B. R. Sthapit, V. A. Parthasarathy, and V. R. Rao, “Isolation and characterization of microsatellite markers in Garciniagummi-gutta by next-generation sequencing and cross-speciesampliﬁcation,” Journal of Genetics, vol. 16, no. 1, pp. 125-129, 2017.

[11] E. Mansyah, E. S. Sobir, and R. Poerwanto, “Assessment of inter simple sequence repeat (ISSR) technique in mangosteen (Garcinia mangostana L.) grow in different Sumatra region,” Journal of Horticulture and Forestry, vol. 2, no. 6, pp. 127-134, 2010.

[12] S. Ratnasingham and P. D. N. Hebert, "Barcoding bold: The Barcode of Life Data System (www.barcodinglife.org),” Molecular Ecology Notes, vol. 7, no. 3, pp. 355-364, 2007.

[13] D. V. Dinh, T. T. Nguyen, T. T. H. Vu, T. P. Luu, and Q. N. Vu, “Using ITS-rDNA nuclear barcode to identify yen tu egg-flower (Magnolia sp.) species,” Biotechnology & Plant Varieties, no. 2, pp. 42-48, 2021.

[14] C. Le and T. H. Le, Forest Plants. Agricultural Publishing House, Hanoi, 2000.

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.10486

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ