NGHIÊN CỨU GẮN KẾT PHÂN TỬ VÀ ĐỘNG LỰC HỌC PHÂN TỬ IN SILICO CỦA CÂY CHỔI SỂ (BAECKEA FRUTESCENS L.) ĐỐI VỚI TNF-α TRONG ĐIỀU TRỊ CÁC BỆNH DO VIÊM GÂY RA

Tóm tắt

Tumor Necrosis Factor-alpha (TNF-α) là một cytokine quan trọng trong hệ miễn dịch. Tuy nhiên, sự sản sinh quá mức TNF-α có thể dẫn đến sự phát triển các bệnh viêm mạn tính. Những năm gần đây, các hợp chất thiên nhiên có tiềm năng về độ an toàn và hiệu quả trong việc ức chế hoạt tính của TNF-α đang thu hút nhiều sự chú ý. Trong nghiên cứu này, chúng tôi sử dụng phương pháp gắn kết phân tử để sàng lọc và đánh giá các hợp chất hóa thực vật có trong cây Chổi sể (Baeckea frutescens L.), nhằm xác định các chất ức chế TNF-α tiềm năng. Kết quả cho thấy 10 hợp chất nổi bật có ái lực liên kết mạnh đáng kể so với hợp chất đối chứng SPD304, bao gồm baefrutone F, frutescone C, frutescone F, betulinic acid, baeckein A, baeckein B, baeckein F, baeckein G, baeckein I và BF-6. Các hệ phức TNF-α–ligand này tiếp tục được phân tích bằng mô phỏng động lực học phân tử và tính toán năng lượng tự do liên kết sử dụng phương pháp MM-GBSA. Kết quả cho thấy, các phức hợp TNF-α–baefrutone F, TNF-α–baeckein F, TNF-α–baeckein G, TNF-α–baeckein I và TNF-α–BF-6 duy trì được độ ổn định cấu trúc trong suốt quá trình mô phỏng 50 ns và thể hiện năng lượng tự do liên kết ước tính tốt hơn SPD304. Những phát hiện này giúp định hướng các hợp chất thiên nhiên tiềm năng được tìm thấy trong loài Chổi sể làm nguyên liệu để phát triển thuốc chống viêm hiệu quả, đồng thời cung cấp cơ sở khoa học cho các nghiên cứu thực nghiệm tiếp theo.