Chia sẻ bài báo qua Email KHẢO SÁT QUY TRÌNH LY TRÍCH NHANH DNA - ĐỀ XUẤT QUY TRÌNH LY TRÍCH TỐI ƯU CHO NIÊM MẠC MIỆNG ỨNG DỤNG TRONG XÉT NGHIỆM QUAN HỆ HUYẾT THỐNG
Thông tin bài báo
Ngày nhận bài: 23/07/20 Ngày hoàn thiện: 14/09/20 Ngày đăng: 21/10/20Các tác giả
1. Huỳnh Viết Lộc, Viện Sinh học Phân tử LOCI2. Tăng Ngọc Kiều Vy
, Viện Sinh học Phân tử LOCI3. Dương Hồ Diễm Trâm, Viện Sinh học Phân tử LOCI
4. Chu Nguyễn Thanh Thủy, Viện Sinh học Phân tử LOCI
Tóm tắt
Khảo sát một số quy trình ly trích đã có cho thấy, phương pháp ly trích nhanh DNA bằng NaOH -SDS kết hợp với sốc nhiệt cho kết quả khả quan hơn so với các phương pháp còn lại. Khi so sánh hiệu quả ly trích ở các nồng độ SDS khác nhau, 0,01% là nồng độ SDS tối ưu. Quy trình đề xuất được đánh giá thông qua việc so sánh với bộ ly trích cột thương mại OMEGA và ly trích thử nghiệm trên 200 mẫu niêm mạc miệng. Kết quả so sánh với bộ ly trích thương mại, DNA ly trích bởi quy trình đề xuất cho sản phẩm PCR có cường độ huỳnh quang trung bình thấp hơn nhưng kết quả phân tích vẫn chính xác và trùng khớp. Trên 200 mẫu thực tế, không có mẫu nào bị ức chế, hơn 90% mẫu cho sản phẩm PCR có cường độ huỳnh quang trên 100 RFU và 100% cho tín hiệu cao trên 50 RFU. Đối với các cặp mẫu đã biết mối quan hệ huyết thống, kết quả trả về là trùng khớp.
Từ khóa
Toàn văn:
PDFTài liệu tham khảo
[1]. O. Nick, "The Basics: How Phenol Extraction Works," 2015. [Online]. Available: http://bitesizebio.com/384/the-basics-how-phenol-extraction-works. [Accessed Aug. 25, 2015].
[2]. S. Berensmeier, “Magnetic particles for the separation and purification of nucleic acids,” Applied Microbiology and Biotechnology, vol. 73, no.3, pp. 495-504, 2006.
[3]. M. Miura et al., “Comparison of six commercially-available DNA polymerases for direct PCR,” Rev. Inst. Med. Trop. Sao Paulo, vol. 55, no. 6, pp. 401-406, 2013.
[4]. B. K. Milko, “Mutants of Taq DNA polymerase resistant to PCR inhibitors allow DNA amplification from whole blood and crude soil samples,” Nucleic Acids Research, vol. 37, no. 5, pp. 40-58, 2009.
[5]. M. S. Adamowicz1 et al., “Evaluation of Methods to Improve the Extraction and Recovery of DNA from Cotton Swabs for Forensic Analysis,” Plos one, vol. 9, p. 2, 2014.
[6]. L. Moore, “Evaluation of buccal cell collection protocols for genetic susceptibility studies,” Biomarkers, vol. 6, no. 6, pp. 448- 454, 2001.
[7]. PowerPlex® Fusion System Technical Manual, Promega Corporation, TMD039, 2017.
[8]. Daniel, “A Simple "Universal" DNA Extraction Procedure Using SDS and Proteinase K Is Compatible with Direct PCR Amplification,” Genome Research, vol. 4, pp. 368-370, 1995.
[9]. B. Richards. “Multiplex PCR amplification from the CFTR gene using DNA prepared from buccal brushes/swab,” Human Molecular Genetics, vol. 2, no. 2, pp. 159-163, 1992.
[10]. M. Klintschar, and F. Neuhuber, “Evaluation of an alkaline lysis method for the extraction of DNA from whole blood and forensic stains for STR analysis,” J Forensic Sci, vol. 45, pp. 669-673, 2000.
[11]. A. H. Walker et al., “Collection of Genomic DNA by Buccal Swabs for Polymerase Chain Reaction-Based Biomarker Assays,” Environmental Health Perspectives, vol. 107, pp. 517-520, 1999.
[12]. K. Sung et al., “A simple and effcient Triton X-100 boiling and chloroform extraction method of RNA isolation from Gram-positive and Gram-negative bacteria,” FEMS Microbiology Letters, vol. 229, pp. 97-101, 2003.
[13]. J. M. Walker, The Protein Protocols Handbook. (Third Edition). New York (NY): Springer-Verlag New York, LLC, 2009.
Các bài báo tham chiếu
- Hiện tại không có bài báo tham chiếu