NGHIÊN CỨU MỐI QUAN HỆ PHÁT SINH CỦA  CÁC LOÀI MACROSOLEN (BLUME) RCHB. (LORANTHACEAE)  Ở VIỆT NAM DỰA TRÊN DỮ LIỆU PHÂN TỬ

Lê Chí Toàn

doi:10.34238/tnu-jst.5696

NGHIÊN CỨU MỐI QUAN HỆ PHÁT SINH CỦA CÁC LOÀI MACROSOLEN (BLUME) RCHB. (LORANTHACEAE) Ở VIỆT NAM DỰA TRÊN DỮ LIỆU PHÂN TỬ

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 16/03/22 Ngày hoàn thiện: 27/04/22 Ngày đăng: 28/04/22

Các tác giả

Lê Chí Toàn , Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2

Tóm tắt

Khám phá mối quan hệ phát sinh loài giữa các đơn vị phân loại cung cấp thông tin quan trọng cho khoa học. Nghiên cứu phát sinh loài của chi Macrosolen được thực hiện dựa trên bộ dữ liệu phân tử của 27 mẫu nghiên cứu với năm vùng DNA bao gồm các gen lục lạp rbcL, matK, và trnL-F và gen nhân (SSU rDNA và LSU rDNA). Các phương pháp Maximum likelihood (ML) và Bayesian inference (BI) được sử dụng để xây dựng cây phát sinh loài. Các kết quả phân tích dữ liệu phân tử ủng hộ mạnh mẽ rằng Macrosolen không phải là đơn phát sinh với hai nhánh phát sinh chính trong chi này. Sự đan xen vào nhau của ba chi Elytranthe, Lepidaria và Macrosolen trên cây phát sinh được ghi nhận là tương đồng với dữ liệu hình thái, phân tử và sự phân bố của chúng, tuy nhiên cần nghiên cứu thêm để giải quyết rõ ràng các ranh giới cho một sắp xếp phân loại chắc chắn cho ba chi. Loài đặc hữu M. bidoupensis của Việt Nam có quan hệ di truyền gần gũi với M. tricolor dựa trên dữ liệu phân tử. Nhìn chung, các mẫu Macrosolen ở Việt Nam có sự tương đồng di truyền với các mẫu của chi này từ các nước khác.

Từ khóa

Phát sinh loài phân tử; Không đơn phát sinh; Macrosolen; Đan xen; Tương đồng di truyền

Toàn văn:

PDF (English)

Tài liệu tham khảo

[1] D. L. Nickrent, “The Parasitic Plant Connection,” 1997 onwards. [Online]. Available: http://parasiticplants.siu.edu. [Accessed March 2022].

[2] B. Liu, C. T. Le, R. L. Barrett, D. L. Nickrent, Z. D. Chen, L. M. Lu, and R. Vidal-Russell, “Diversification agrees with emergence of tropical forests and radiation of songbirds,” Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 124, pp. 199-212, 2018.

[3] H. H. Pham, An Illustrated Flora Vietnam, vol. 2, Ho Chi Minh City: Young Publishing House, 2003.

[4] H. S. Qiu and M. G. Gilbert, “Loranthaceae,” in Flora of China, vol. 5, Z. Y. Wu, P. H. Raven and D. Y. Hong, Eds., Beijing: Science Press, St. Louis: Missouri Botanical Garden Press, 2003, pp. 220-239.

[5] J. Kuijt, “Santalales,” in The families and genera of vascular plants Flowering plants: Eudicots; Santalales, Balanophorales, vol. 12, J. Kuijt and B. Hansen, Eds., Cham, Switzerland: Springer, 2015, pp. 137-141.

[6] C. A. Wilson and C. L. Calvin, “An origin of aerial branch parasitism in the mistletoe family, Loranthaceae,” American Journal of Botany, vol. 93, pp. 787-79, 2006.

[7] R. Vidal-Russell and D. L. Nickrent, “Evolutionary relationship in the showy Mistletoe family (Loranthaceae),” American Journal of Botany, vol. 95, pp. 1015-1029, 2008a.

[8] R. Vidal-Russell and D. L. Nickrent, “The first mistletoes, origins of aerial parasitism in Santalales,” Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 47, pp. 523-537, 2008b.

[9] D. L. Nickrent, V. Malécot, R. Vidal-Russell, and J. P. Der, “A revised classification of Santalales,” Taxon, vol. 592, pp. 538-558, 2010.

[10] S. Tagane, V. S. Dang, N. V. Ngoc, H. T. Binh, N. Komada, J.S. Wai, A. Naiki, H. Nagamasu, H. Toyama, and T. Yahara, “Macrosolen bidoupensis (Loranthaceae), a new species from Bidoup Nui Ba National Park, southern Vietnam,” PhytoKeys, vol. 80, pp. 113-120, 2017.

[11] P. Taberlet, L. Gielly, G. Pautou, and J. Bouvet, “Universal primers for amplification of three non-coding regions of chloroplast DNA,” Plant Molecular Biology, vol. 17, pp.1105-1109, 1991.

[12] A. Drummond, B. Ashton, S. Buxton, M. Cheung, A. Cooper, C. Duran, M. Field, J. Heled, M. Kearse, S. Markowitz, R. Moir, S. Stones-Havas, S. Sturrock, T. Thierer, and A. Wilson, “Geneious,” version 5.4, 2011. [Online]. Available: http://www.geneious.com. [Accessed December 2021].

[13] R. C. Edgar, “MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput,” Nucleic Acids Research, vol. 32, pp. 1792-1797, 2004.

[14] A. Stamatakis, “RAxML-VI-HPC, maximum likelihood-based phylogenetic analyses with thousands of taxa and mixed models,” Bioinformatics, vol. 2221, pp. 2688-2690, 2006.

[15] A. Stamatakis, P. Hoover, and J. Rougemont, “A Rapid Bootstrap Algorithm for the RAxML Web Servers,” Systematics Biology, vol. 575, pp. 758-771, 2008.

[16] D. Darriba, G. L. Taboada, , R. Doallo, and D. Posada, “jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing,” Nature Methods, vol. 9, pp. 772, 2012.

[17] F. Ronquist, M. Teslenko, P. van der Mark, D. L. Ayres, A. Darling, S. Höhna, B. Larget, L. Liu, M. A. Suchard, and J. P. Huelsenbeck, “MrBayes 3.2: Efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space,” Systematic Biology, vol. 61, pp. 539-542, 2012.

[18] A. Rambaut, M. A. Suchard, D. Xie, and A. J. Drummond, “Tracer v.1.6,” 2014. [Online]. Available: http://tree.bio.ed.ac.uk/software/tracer. [Accessed January 2022].

[19] D. L. Swofford, PAUP*: Phylogenetic analysis using parsimony (* and other methods), ver. 4.0.b10, Sunderland: Sinauer Associates, 2002.

[20] V. Malécot and D. L. Nickrent, “Molecular phylogenetic relationships of Olacaceae and related Santalales,” Systematic Botany, vol. 33, pp. 97-106, 2008.

[21] V. Manzanilla, A. Kool, N. L. Nguyen, V. H. Nong, T. T. H. Le, and H. De Boer, “Phylogenomics and barcoding of Panax: Toward the identifcation of ginseng species,” BMC Evolutionary Biology, vol. 18, pp. 1-14, 2018.

[22] N. L. Nguyen, L. B. H. Pham, T. T. H. Huynh, H. H. Nguyen, H. H. Ha, D. T. Nguyen, and T. T. H. Le, “Species discrimination of novel chloroplast DNA barcodes and their application for identifcation of Panax (Aralioideae, Araliaceae),” PhytoKeys, vol. 188, pp. 1-18, 2022.

[23] B. H. Danser, “Miscellaneous notes on Loranthaceae,” Blumea, vol. 2, pp. 34-59, 1936.

[24] B. A. Barlow, “Loranthaceae,” in Flora Malesiana Series 1, vol. 13, C. Kalkman, P. F. Stevens, D. W. Kirkup, W. J. J. O. de Wilde, and H. P. Nooteboom, Eds. Leiden: National Herbarium of the Netherlands, 1997, pp. 209-401.

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.5696

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ