Chia sẻ bài báo qua Email TỐI ƯU HÓA QUY TRÌNH PHÁT HIỆN Hepatopancreatic parvovirus (HPV) VÀ Monodon baculovirus (MBV) TRÊN TÔM BẰNG PHƯƠNG PHÁP DUPLEX REALTIME PCR
Thông tin bài báo
Ngày nhận bài: 06/07/22 Ngày hoàn thiện: 07/12/22 Ngày đăng: 20/12/22Các tác giả
1. Nguyễn Phạm Trúc Phương
, Trung tâm Nghiên cứu và Phát triển Nông nghiệp Công nghệ cao2. Nguyễn Phạm Phương Thảo, Trung tâm Nghiên cứu và Phát triển Nông nghiệp Công nghệ cao
Tóm tắt
MBV (Monodon baculovirus) và HPV (Hepatopancreatic parvovirus) đều là virus ký sinh trên tế bào biểu bì gan tụy và tế bào biểu bì ruột của tôm, gây chết tôm ở giai đoạn ấu trùng Zoea, mysis và tôm giống nhỏ,… nên ảnh hưởng nghiêm trọng đến ngành công nghiệp nuôi tôm. Vì vậy, nghiên cứu này đã phát triển quy trình duplex realtime PCR bằng cách sử dụng đầu dò TaqMan để phát hiện nhanh và chính xác đồng thời monodon baculovirus (MBV) và hepatopancreatic parvovirus (HPV) trong cùng 1 phản ứng. Sau quá trình tối ưu các thành phần và điều kiện cần thiết như tỉ lệ mồi HPVth/MBV 400 nM/400 nM, tỉ lệ probe HPV-P1/MBV-P1 là 300 nM/300 nM với điều kiện phản ứng như sau: 94ºC trong 5 phút, tiếp theo 94ºC trong 15 giây, 60ºC trong 60 giây, chu kỳ này được lặp lại 40 lần. Kết quả nghiên cứu cho thấy phương pháp được xây dựng có độ đặc hiệu (SP) đạt 100%; độ chính xác (AC) đạt 100%; độ nhạy (SE) đạt 100%; tỷ lệ âm tính giả 0% và tỷ lệ dương tính giả 0%, LOD50 là 5 copy/phản ứng.
Từ khóa
Toàn văn:
PDFTài liệu tham khảo
[1] K. F. J. Tang and D. V. Lightner, “Duplex realtime PCR for detection and quantification of monodon baculovirus (MBV) and hepatopancreatic parvovirus (HPV) in Penaeus monodon,” Diseases of Aquatic Organisms, vol. 93, pp. 191-198, 2011.
[2] D. C Yan, K. F. J. Tang, and D. V. Lightner, “Development of a realtime PCR assay for detection of monodon baculovirus (MBV) in penaeid shrimp,” Journal of Invertebrate Pathology, vol. 102, pp. 97-100, 2009.
[3] M. P. Safeena, P. Rai, and I. Karunasagar, “Molecular Biology and Epidemiology of Hepatopancreatic parvovirus of Penaeid Shrimp,” Indian Journal of Virology, vol. 23, no. 2, pp. 191-202, 2012.
[4] W. Sukhumsirichart, W. Kiatpathomchai, C. Wongteerasupaya, B. Withyachumnarnkul, T. W. Flegel, V. Boonseang, and S. Panyim, “Detection of hepatopancreatic parvovirus (HPV) infection in Penaeus monodon using PCR-ELISA,” Molecular and Cellular Probes, vol. 16, pp. 409-413, 2002.
[5] O. H. T. Dang, T. D. N. Tran, and T. V. Tran, “Multiplex PCR protocol for stimultaneous detection of white spot syndrome virus (WSSV) and hepatopancreatic parvovirus (HPV) in black tiger shrimp (Penaeus monodon),” Can Tho University Journal of Science, vol. 3, pp. 144-150, 2010.
[6] S. Jeeva, N. I. Kim, I. K. Jang, and T. J. Choi, “Development of Two Quantitative Realtime PCR Diagnostic Kits for HPV Isolates from Korea,” Journal of Microbiology and Biotechnology, vol. 22, no. 10, pp. 1350-1358, 2012.
[7] R. Yadav, A. Paria, S. Mankame, M. Makesh, A. Chaudhari, and K. V. Rajendran, “Development of SYBR Green and TaqMan quantitative realtime PCR assays for hepatopancreatic parvovirus (HPV) infecting Penaeus monodon in India,” Molecular and Cellular Probes, vol. 29, no. 6, pp. 442-448, 2015.
[8] D. R. Kumar, M. Sanjuktha, J. J. S. Rajan, R. A. Bharathi, T. C. Santiago, S. V. Alavandi, and M. Poornima, “Development of SYBR Green based real time PCR assay for detection of monodon baculovirus in Penaeus monodon,” Journal of Virological Methods, vol. 205, pp. 81-86, 2014.
[9] W. Sukhumsirichart, C. Wongteerasupaya, V. Boonsaeng, S. Panyim, S. Sriurairatana, B. Withyachumnarnkul, and T. W. Flege, “Characterization and PCR detection of hepatopancreatic parvovirus (HPV) from Penaeus monodon in Thailand,” Diseases of Aquatic Organisms, vol. 38, pp. 1-10, 1999.
[10] OIE, Hepatopancreatic parvovirus disease, OIE Aquatic Animal Disease Cards, 2007.DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.6237
Các bài báo tham chiếu
- Hiện tại không có bài báo tham chiếu