Chia sẻ bài báo qua Email SỬ DỤNG MÃ VẠCH DNA TRONG VIỆC ĐỊNH LOẠI CÁ NHEO TẠI THÁI NGUYÊN
Thông tin bài báo
Ngày nhận bài: 23/02/21 Ngày hoàn thiện: 24/03/21 Ngày đăng: 28/05/21Các tác giả
1. Hoàng Thị Thu Yến
, Trường Đại học Khoa học - ĐH Thái Nguyên2. Nguyễn Thị Yến, Trường Đại học Khoa học - ĐH Thái Nguyên
Tóm tắt
Gen mã hóa cytochrome c oxidase subunit I (COI) ở ty thể được sử dụng nhiều để nghiên cứu phân loại phân tử ở động vật. Trong nghiên cứu này, chúng tôi phân tích trình tự đoạn gen COI phân lập từ mẫu cá nheo Thái Nguyên. Đoạn gen COI được phân lập từ DNA genome mẫu cá nheo bằng kỹ thuật PCR. Sau đó, sản phẩm PCR được tinh sạch và xác định trình tự, đoạn gen COI thu được có chiều dài 616 bp. Trình tự nucleotide đoạn gen COI được so sánh với các trình tự đã công bố trên Genbank bằng cách sử dụng phần mềm Blast. Kết quả so sánh chỉ ra, đoạn gen COI nghiên cứu không có cơ sở khoa học để định danh đến loài trong chi cá nheo Silurus. Sử dụng phần mềm Bioedit so sánh trình tự nucleotide đoạn gen COI cho thấy, mẫu cá nheo nghiên cứu có thể là 1 loài khác so với các loài đã công bố thuộc chi cá nheo Silurus.
Từ khóa
Toàn văn:
PDFTài liệu tham khảo
[1] J. A. Castro, A. Picornell, and M. Ramon, "Mitochondrial DNA: a tool for populational genetics studies," Int Microbiol, vol. 1, no. 4, pp. 327-332, 1998.
[2] A. K. Singh, R. Kumar, M. Singh, A. K. Mishra, U. K. Chauhan, V. S. Baisvar, R. Verma, N. S. Nagpure, and B. Kushwaha, "Mitochondrial 16S rRNA gene-based evolutionary divergence and molecular phylogeny of Barilius spp," Mitochondrial DNA, vol. 26, no. 1, pp. 41-47, 2015.
[3] K. Tamura, G. Stecher, D. Peterson, A. Filipski, and S. Kumar, "MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0," Mol Biol Evol, vol. 30, no. 12, pp. 2725-2729, 2013.
[4] S. R. Zhu, J. J. Fu, Q. Wang, and J. L. Li, "Identification of Channa species using the partial cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene as a DNA barcoding marker," Biochemical Systematics and Ecology, vol. 51, pp. 117-122, 2013.
[5] Fishbase, "Silurus", 2020. [Online]. Available: https://www.fishbase.se/Nomenclature/ScientificNameSearchList.php. [Accessed Feb. 22, 2021].
[6] Q. R. Wang, Z. Q. Wei, and P. Y. Song, "Genetic Diversity of Silurus asotus on Mitochondrial DNA 16S rRNA gene partical sequence," Journal of Animal and Veterinary Advances, vol. 11, no. 11, pp. 1843-1846, 2012.
[7] V. H. Nguyen, T. H. N. Vu, and T. D. P. Nguyen, "Three Fish Species of The Genus Silurus Linnaeus, 1758, (Siluridae, Siluriformes) Newly Discovered in Northern Vietnam," J. Sci. &Devel., vol. 13, no. 1, pp. 65-74, 2015.
Các bài báo tham chiếu
- Hiện tại không có bài báo tham chiếu