PHÂN TÍCH DỮ LIỆU CHẤT CHUYỂN HOÁ THỨ CẤP TRONG CÂY NGÂN HOA (Grevillea robusta A.Cunn. ex R.Br.) HƯỚNG TÁC DỤNG CHỐNG FtsZ

Bùi Quốc Dũng

doi:10.34238/tnu-jst.9262

PHÂN TÍCH DỮ LIỆU CHẤT CHUYỂN HOÁ THỨ CẤP TRONG CÂY NGÂN HOA (Grevillea robusta A.Cunn. ex R.Br.) HƯỚNG TÁC DỤNG CHỐNG FtsZ

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 20/11/23 Ngày hoàn thiện: 05/03/24 Ngày đăng: 11/03/24

Các tác giả

Bùi Quốc Dũng , Trường Đại học Y Dược Buôn Ma Thuột

Tóm tắt

Nhiều nghiên cứu chỉ ra rằng cây Ngân hoa chứa nhiều hợp chất có khả năng kháng khuẩn, đặc biệt nhắm mục tiêu mới của vi khuẩn là FtsZ. Nghiên cứu này được thực hiện với mong muốn dự đoán khả năng ức chế FtsZ quy mô phân tử, hỗ trợ các nghiên cứu thực nghiệm. Chất chuyển hoá của Ngân hoa được sưu tập từ các bài báo trong thư viện Pubmed, Researchgate. Cấu trúc tinh thể 6YD5 trên ngân hàng cơ sở dữ liệu protein (RCSB) được sử dụng. Dữ liệu thô và dữ liệu sau khi có kết quả docking được xử lý và trực quan hoá với ngôn ngữ lập trình Python bằng trình biên tập mã Visual Studio Code và các thư viện hỗ trợ pandas, matplotlib, seaborn. 125 chất trong 9 bài báo từ năm 2000 đến năm 2021 đã được thu thập. Nhóm có số lượng chất nổi trội là phenol với 105 chất. 68 chất docking được, trong tổng số 103 chất. Quercetin là một flavonoid cho điểm số docking thấp nhất -22,7 kJ/mol. Các hợp chất phenolic đơn giản (phenolic acid, phenolic ester, phân nhóm khác có cấu trúc phenol đơn giản và coumarin) cũng như polyphenol (flavonoid) là những hợp chất tiềm năng chống vi khuẩn theo cơ chế kháng FtsZ. Phân đoạn ethyl acetat và cloroform là phân đoạn có thể cho tác dụng ức chế FtsZ tốt. Nên sử dụng lá, hoa để chiết xuất.

Từ khóa

Grevillea robusta; Phenolic; FtsZ; Docking; Kháng khuẩn

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

[1] V. M. Tran, Handbook of trees and ornamental flowers grown on campus, The Ho Chi Minh City Department of Agriculture and Rural Development, 2011.

[2] A. S. Ahmed, N. Nakamura, M. R. Meselhy, M. A. Makhboul, N. El-Emary, and M. Hattori, "Phenolic constituents from Grevillea robusta," Phytochemistry, vol. 53, no. 1, pp. 149-54, Jan 2000, doi: 10.1016/s0031-9422(99)00484-7.

[3] S. D. Wei, Y. M. Lin, M. M. Liao, W. M. Chai, and H. Zhou, "Structural Composition and Free Radical Scavenging Activity of Proanthocyanidins Extracted from Grevillea robusta," Records of Natural Products, vol. 6, pp. 218-229, 2012.

[4] A. Ahmed and M. A. Makboul, "Chemical investigation of Grevillea robusta A.Cunn flowers," Sphinx Journal of Pharmaceutical and Medical Sciences, vol. 2, no. 1, pp. 1-8, 2021, doi: 10.21608/sjpms.2021.95637.1000.

[5] K.-W. Wang, T.-T. Zhang, and L. Zhang, "Chemical Constituents and Biological Activities of Grevillea robusta," Chemistry of Natural Compounds, vol. 54, 2018, doi: 10.1007/s10600-018-2279-1.

[6] M. Ullah, M. A. A. Sikder, T. Sharmin, and M. Rashid, "Pharmacological Activities of Grevillea robusta, a Medicinal Plant of Bangladesh," Bangladesh Phramaceutical Journa, vol. 17, pp. 135-137, 2014, doi: 10.3329/bpj.v17i2.22329.

[7] I. E. Cock, "Grevillea juncifolia Hook. and Grevillea robusta A. Cunn. Ex. R. Br. Methanolic Leaf and Flower Extracts Inhibit the Growth of Gram Positive and Gram Negative Bacteria," Pharmacognosy Communications, vol. 9, pp. 112-117, 2019, doi: 10.5530/pc.2019.3.23.

[8] X. H. T. Hoang and T. H. Nguyen, "Screening of potential inhibitor for FtsZ GTPase activity from plants collected in central of Viet Nam," Journal of Medicine and Pharmacy, pp. 11-16, 2019, doi: 10.34071/jmp.2019.3.2.

[9] H. Han et al., "Recent progress of bacterial FtsZ inhibitors with a focus on peptides," The FEBS Journal, vol. 288, 2020, doi: 10.1111/febs.15489.

[10] Y. Yamashita, K. Matsunami, H. Otsuka, T. Shinzato, and Y. Takeda, "5-Alkylresorcinol glucosides from the leaves of Grevillea robusta Allan Cunningham," J. Nat. Med., vol. 64, no. 4, pp. 474-477, Oct. 2010, doi: 10.1007/s11418-010-0420-y.

[11] T.-H. Chuang, H.-H. Chan, T.-S. Wu, and C.-F. Li, "Chemical constituents and biological studies of the leaves of Grevillea robusta," Molecules, vol. 16, no. 11, pp. 9331-9339, 2011, doi: 10.3390/molecules16119331.

[12] Y. Yamashita, K. Matsunami, H. Otsuka, T. Shinzato, and Y. Takeda, "Grevillosides A–F: Glucosides of 5-alkylresorcinol derivatives from leaves of Grevillea robusta," Phytochemistry, vol. 69, no. 15, pp. 2749-2752, 2008, doi: 10.1016/j.phytochem.2008.08.008.

[13] Y. Yamashita-Higuchi, S. Sugimoto, K. Matsunami, H. Otsuka, and T. Nakai, "Grevillosides J-Q, arbutin derivatives from the leaves of Grevillea robusta and their melanogenesis inhibitory activity," Chem. Pharm. Bull. (Tokyo), vol. 62, no. 4, pp. 364-372, 2014, doi: 10.1248/cpb.c13-00962.

[14] A. Ahmed, "Phytochemical and biological study of Grevillea robusta A. Cunn cultivated in Egypt," Bulletin of Pharmaceutical Sciences, vol. 29, pp. 272-288, 2006, doi: 10.21608/bfsa.2006.65200.

[15] Y. Yamashita-Higuchi, S. Sugimoto, K. Matsunami, and H. Otsuka, "Reinvestigation of structures of robustasides B and C, and isolation of (E)-2,5-dihydroxycinnamic acid esters of arbutin and glucose from the leaves of Grevillea robusta," Chem. Pharm. Bull. (Tokyo), vol. 60, no. 10, pp. 1347-1350, 2012, doi: 10.1248/cpb.c12-00549.

[16] K. A. Hurley, T. M. A. Santos, G. M. Nepomuceno, V. Huynh, J. T. Shaw, and D. B. Weibel, "Targeting the Bacterial Division Protein FtsZ," J. Med. Chem., vol. 59, no. 15, pp. 6975-6998, 2016, doi: 10.1021/acs.jmedchem.5b01098.

[17] K. Kanoh et al., "New Sulfoalkylresorcinol from Marine-derived Fungus, Zygosporium sp. KNC52," The Journal of Antibiotics, vol. 61, no. 3, pp. 192-194, 2008, doi: 10.1038/ja.2008.29.

[18] F. Naz et al., "Screening of plant-based natural compounds as an inhibitor of FtsZ from Salmonella Typhi using the computational, biochemical and in vitro cell-based studies," Int. J. Biol. Macromol., vol. 219, pp. 428-437, 2022, doi: 10.1016/j.ijbiomac.2022.07.241.

[19] N. Rastogi, P. Domadia, S. Shetty, and D. Dasgupta, "Screening of natural phenolic compounds for potential to inhibit bacterial cell division protein FtsZ," Indian J. Exp. Biol., vol. 46, no. 11, pp. 783-787, Nov. 2008.

[20] N. Silber, C. L. Matos de Opitz, C. Mayer, and P. Sass, "Cell division protein FtsZ: from structure and mechanism to antibiotic target," Future Microbiol., vol. 15, pp. 801-831, Jun. 2020, doi: 10.2217/fmb-2019-0348.

"Times New Roman",serif;mso-fareast-font-family:"Times New Roman";mso-ansi-language:

PT-BR;mso-fareast-language:EN-US;mso-bidi-language:AR-SA'>

style='mso-element:field-end'>

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.9262

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ