NGHIÊN CỨU DOCKING PHÂN TỬ VÀ ĐẶC TÍNH GIỐNG THUỐC CỦA HỢP CHẤT SAPONIN T-17 PHÂN LẬP TỪ LOÀI Tupistra chinensis Baker

Bùi Văn Lực; Từ Quang Tân; Nguyễn Đức Hùng; Chu Hoàng Mậu

doi:10.34238/tnu-jst.13226

NGHIÊN CỨU DOCKING PHÂN TỬ VÀ ĐẶC TÍNH GIỐNG THUỐC CỦA HỢP CHẤT SAPONIN T-17 PHÂN LẬP TỪ LOÀI Tupistra chinensis Baker

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 14/07/25 Ngày hoàn thiện: 14/08/25 Ngày đăng: 14/08/25

Các tác giả

1. Bùi Văn Lực, Trường Trung học cơ sở Cửa Ông, tỉnh Quảng Ninh
2. Từ Quang Tân, Trường Đại học Sư phạm – ĐH Thái Nguyên
3. Nguyễn Đức Hùng , Trường Đại học Sư phạm – ĐH Thái Nguyên
4. Chu Hoàng Mậu, Trường Đại học Sư phạm – ĐH Thái Nguyên

Tóm tắt

Ung thư dạ dày, một gánh nặng sức khỏe toàn cầu lớn lao với vị trí thứ năm về mức độ phổ biến và thứ tư về nguyên nhân tử vong liên quan đến ung thư, thúc đẩy việc tìm kiếm các liệu pháp mới mẻ. Các nghiên cứu gần đây nhấn mạnh saponin steroid T-17 chiết xuất từ Tupistra chinensis Baker như các lựa chọn tự nhiên thay thế tiềm năng, nhắm đến apoptosis, một quá trình chết tế bào theo chương trình thiết yếu nhằm loại bỏ các tế bào bị tổn thương. Bcl-xl, một protein chống apoptosis, ức chế apoptosis bằng cách ngăn chặn sự phóng thích các yếu tố thúc đẩy apoptosis từ ty thể, biến nó thành một mục tiêu then chốt trong điều trị ung thư. Nghiên cứu này đã khảo sát cơ chế phân tử của T-17 như một tác nhân chống ung thư đối với Bcl-xl (3SPF) trong ung thư dạ dày ở người sử dụng các tiếp cận in silico. Docking phân tử đã tiết lộ rằng T-17 chứng tỏ độ ổn định vượt trội và khả năng định vị hóa tốt hơn trong túi protein 3SPF so với ABT-737. Phân tích ADMET in silico chỉ ra hồ sơ dược động học thuận lợi của T-17, bao gồm khả năng hấp thụ khả quan và chuyển hóa ổn định, mà không có lo ngại về độc tính AMES. Những phát hiện này định vị T-17 như một hợp chất dẫn đầu triển vọng cho liệu pháp ung thư dạ dày bằng cách ức chế apoptosis trung gian qua Bcl-xl, cung cấp nền tảng cho việc thiết kế các hợp chất an toàn hơn, hiệu quả hơn nhắm đến các con đường apoptosis trong điều trị ung thư.

Từ khóa

3SPF; Chết theo chương trình; Đặc tính giống thuốc; Docking phân tử; Saponin T-17; Tupistra chinensis Baker

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

[1] F. Bray, M. Laversanne, H. Sung, J. Ferlay, R. L. Siegel, I. Soerjomataram, and A. Jemal, “Global cancer statistics 2022: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries,” CA. Cancer J. Clin., vol. 74, no. 3, pp. 229–263, May 2024.

[2] V. Mansouri, N. Beheshtizadeh, M. Gharibshahian, L. Sabouri, M. Varzandeh, and N. Rezaei, “Recent advances in regenerative medicine strategies for cancer treatment,” Biomed. Pharmacother., vol. 141, 2021, Art. no. 111875.

[3] G. Leng, B. Duan, J. Liu, S. Li, W. Zhao, S. Wang, G. Hou, and J. Qu, “The advancements and prospective developments in anti-tumor targeted therapy,” Neoplasia, vol. 56, 2024, Art. no. 101024.

[4] M. A. Rahman, S. M. Rakib-Uz-Zaman, S. Chakraborti, S. K. Bhajan, R. D. Gupta, M. Jalouli, M. A. Parvez, M. H. Shaikh, E. Hoque Apu, A. H. Harrath, S. Moon, and B. Kim, “Advancements in utilizing natural compounds for modulating autophagy in liver cancer: Molecular mechanisms and therapeutic targets,” Cells, vol. 13, no. 14, 2024, Art. no. 1186.

[5] T. Koseki, K. Yamato, S. Krajewski, J. C. Reed, Y. Tsujimoto, and T. Nishihara, “Activin A-induced apoptosis is suppressed by BCL-2,” FEBS Lett., vol. 376, no. 3, pp. 247–250, 1995.

[6] M. Li, D. Wang, J. He, L. Chen, and H. Li, “Bcl-XL: A multifunctional anti-apoptotic protein,” Pharmacol. Res., vol. 151, 2020, Art. no. 104547.

[7] A. Ohtsu, S. Arai, T. Sawada, M. Kato, Y. Maeno, Y. Miyazawa, Y. Fujizuka, Y. Sekine, H. Koike, H. Matsui, and K. Suzuki, “Fibroblast growth factor receptor inhibitor erdafitinib promotes Mcl-1 degradation and synergistically induces apoptosis with Bcl-xL/Bcl-2 inhibitor in urothelial cancer cells,” Biochem. Biophys. Res. Commun., vol. 628, pp. 76–83, 2022.

[8] S. Bouabdallah, A. Al-Maktoum, and A. Amin, “Steroidal saponins: Naturally occurring compounds as inhibitors of the hallmarks of cancer,” Cancers, vol. 15, no. 15, 2023, Art. no. 3900.

[9] D. Lu, L. Huang, and C. Weng, “Unveiling the novel anti-tumor potential of digitonin, a steroidal saponin, in gastric cancer: A network pharmacology and experimental validation study,” Drug Des. Devel. Ther., vol. 19, pp. 2653–2666, 2025.

[10] J. Xu, Z. Wang, Y. Huang, Y. Wang, L. Xiang, and X. He, “A spirostanol saponin isolated from Tupistra chinensis Baker simultaneously induces apoptosis and autophagy by regulating the JNK pathway in human gastric cancer cells,” Steroids, vol. 164, 2020, Art. no. 108737.

[11] N. D. C. Q. Bojórquez and M. R. S. Campos, “Traditional and novel computer-aided drug design (CADD) approaches in the anticancer drug discovery process,” Curr. Cancer Drug Targets, vol. 23, no. 5, pp. 333-345, 2023.

[12] E. Lionta, G. Spyrou, D. K. Vassilatis, and Z. Cournia, “Structure-based virtual screening for drug discovery: principles, applications and recent advances,” Curr. Top. Med. Chem., vol. 14, no. 16, pp. 1923-1938, 2014.

[13] K. Kaavin, D. Naresh, M. R. Yogeshkumar, M. K. Prakash, S. Janarthanan, M. M. Krishnan, and M. Malathi, “In-silico DFT studies and molecular docking evaluation of benzimidazo methoxy quinoline-2-one ligand and its Co, Ni, Cu and Zn complexes as potential inhibitors of Bcl-2, Caspase-3, EGFR, mTOR, and PI3K, cancer-causing proteins,” Chem. Phys. Impact, vol. 8, 2024, Art. no. 100418.

[14] S. Zhang, K. Liu, Y. Liu, X. Hu, and X. Gu, “The role and application of bioinformatics techniques and tools in drug discovery,” Front. Pharmacol., vol. 16, 2025, Art. no. 1547131.

[15] C. V. Hoang, T. Q. Tu, H. D. Nguyen, and M. H. Chu, “In silico studies of saponins from Hoya verticillata var. verticillate with important apoptosis potency,” Lett. Org. Chem., vol. 22, no. 11, pp. 1-9, 2025.

[16] H. Zhou, J. Chen, J. L. Meagher, C.-Y. Yang, A. Aguilar, L. Liu, L. Bai, X. Cong, Q. Cai, X. Fang, J. A. Stuckey, and S. Wang, “Design of Bcl-2 and Bcl-xL Inhibitors with subnanomolar binding affinities based upon a new scaffold,” J. Med. Chem., vol. 55, no. 10, pp. 4664–4682, 2012.

[17] L. L. G. Ferreira and A. D. Andricopulo, “ADMET modeling approaches in drug discovery,” Drug Discov. Today, vol. 24, no. 5, pp. 1157–1165, 2019.

[18] D. E. V. Pires, T. L. Blundell, and D. B. Ascher, “pkCSM: Predicting small-molecule pharmacokinetic and toxicity properties using graph-based signatures,” J. Med. Chem., vol. 58, no. 9, pp. 4066–4072, 2015.

[19] R. Patil, S. Das, A. Stanley, L. Yadav, A. Sudhakar, and A. K. Varma, “Optimized hydrophobic interactions and hydrogen bonding at the target-ligand interface leads the pathways of drug-designing,” PLoS One, vol. 5, no. 8, 2010, Art. no. e12029.

[20] G. Deogratias, D. M. Shadrack, J. J. E. Munissi, G. A. Kinunda, F. R. Jacob, R. P. Mtei, R. J. Masalu, I. Mwakyula, L. W. Kiruri, and S. S. Nyandoro, “Hydrophobic π-π stacking interactions and hydrogen bonds drive self-aggregation of luteolin in water,” J. Mol. Graph. Model., vol. 116, 2022, Art. no. 108243.

[21] C. M. Roth, B. L. Neal, and A. M. Lenhoff, “Van der Waals interactions involving proteins,” Biophys. J., vol. 70, no. 2, pp. 977–987, 1996.

[22] M. Y. Alsedfy, A. A. Ebnalwaled, M. Moustafa, and A. H. Said, “Investigating the binding affinity, molecular dynamics, and ADMET properties of curcumin-IONPs as a mucoadhesive bioavailable oral treatment for iron deficiency anemia,” Sci. Rep., vol. 14, no. 1, 2024, Art. no. 22027.

[23] D. Dahlgren and H. Lennernäs, “Intestinal permeability and drug absorption: predictive experimental, computational and in vivo approaches,” Pharmaceutics, vol. 11, no. 8, 2019, Art. no. 411.

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.13226

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ