SÀNG LỌC ẢO CÁC CHẤT CHỦ VẬN THỤ THỂ DOPAMIN D2

Bùi Quốc Dũng

doi:10.34238/tnu-jst.11643

SÀNG LỌC ẢO CÁC CHẤT CHỦ VẬN THỤ THỂ DOPAMIN D2

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 03/12/24 Ngày hoàn thiện: 10/06/25 Ngày đăng: 11/06/25

Các tác giả

Bùi Quốc Dũng , Trường Đại học Y Dược Buôn Ma Thuột

Tóm tắt

Các chất chủ vận dopamin thường được sử dụng trong bệnh Parkinson, điều trị trầm cảm, tăng prolactin máu và hội chứng chân không yên. Nghiên cứu này mong muốn tìm kiếm các chất chủ vận dopamin D2 tiềm năng nhằm tìm ra các chất chọn lọc và hạn chế tác dụng phụ trong điều trị các bệnh liên quan. Tập chất sàng lọc gồm các tập con như sau: tập ZINC gồm 13.190.317 chất, Drugbank gồm 8.773 chất, TCM gồm 57.423 chất. Các mô hình pharmacophore, BQSAR đã được xây dựng từ trước. Các thông số hấp thu, phân bố, chuyển hoá, thải trừ (ADME) được dự đoán với QikProp bao gồm QPlogPo/w, QPlogS, QPPCaco, QPlogBB, PHOA, #metab, QplogKhsa. Tập chất được sàng lọc theo thứ tự luật 5 Lipinski, pharmacophore, miền ứng dụng và BQSAR, ADME, docking. 50 chất tiềm năng đã được sàng lọc có điểm số docking thấp hơn dopamin, từ -19,6 kJ/mol đến -37,1 kJ/mol. Trong đó, 25 chất thuộc tập Drugbank, 15 chất thuộc tập ZINC và 10 chất thuộc tập TCM. Chất có điểm số docking thấp nhất -37,1 kJ/mol là DB03777 (bisindolylmaleimid I). Theo sau là hai chất DB07456 (-36,1 kJ/mol) và ZINC206231256 (-35,8 kJ/mol). Asp114 là acid amin đóng vai trò quan trọng, liên kết với 39 trong số 51 chất.

Từ khóa

Chất chủ vận; Dopamin D2; Sàng lọc ảo; ADME; Drugbank

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

[1] M. A. Silva, C. Mattern, R. Häcker, C. Tomaz, J. P. Huston, and R. K. Schwarting, "Increased neostriatal dopamine activity after intraperitoneal or intranasal administration of L-DOPA: On the role of benserazide pretreatment," Synapse vol. 27, no. 4, pp. 294-302, 1997.

[2] D. T. Nguyen, D. S. Nhu, H. Q. Nguyen, V. Q. Le, T. D. Hoang, and V. Q. Trinh, "Research of the concentration of dopamine and its metabolites in the cerebrospinal fluid and its relationship with some clinical manifestations in patients with Parkinson's disease," (in Vietnamese), Vietnam Medical Journal, vol. 502, no. 2, pp. 220-224, 2021.

[3] World Health Organization, "Dementia," March 15, 2023. [Online]. Available: https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/dementia. [Accessed August 08, 2024].

[4] P. T. Francis, A. M. Palmer, M. Snape, and G. K. Wilcock, "The cholinergic hypothesis of Alzheimer's disease: a review of progress," J. Neurol. Neurosurg. Psychiatry, vol. 66, no. 2, pp. 137-147, 1999.

[5] A. Martorana and G. Koch, "Is dopamine involved in Alzheimer's disease? " Front. Aging Neurosci., vol. 6, pp. 1-6, 2014.

[6] H. A. Tran et al., "Changes in locomotor activity and learning in animals lacking Dopamine D2 receptors," (in Vietnamese), Vietnam Journal of Physiology, vol. 3, pp. 44-50, 2002.

[7] H. A. Tran, "Effects of dopamine D2 receptors on circadian rhythms and novel environment exploration behavior," (in Vietnamese), Vietnam Journal of Physiology, vol. 2005, no. 1, pp. 53-58, 2005.

[8] C. Missale, S. R. Nash, S. W. Robinson, M. Jaber, and M. G. Caron, "Dopamine Receptors: From Structure to Function," Physiol. Rev., vol. 78, no. 1, pp. 189-225, 1998.

[9] R. Braga et al., "Virtual Screening Strategies in Medicinal Chemistry: The State of the Art and Current Challenges," Current Topics in Medicinal Chemistry, vol. 14, pp. 1899-1912, 2014.

[10] Q. D. Bui, K. M. Thai, Q. H. Tran, T. T. N. Tran, and M. T. Le, "Binary QSAR study on dopamine 2 receptor agonists in relation to Alzheimer's disease," (in Vietnamese), Journal of Medicine and Pharmacy - Ministry of Health, vol. 2, pp. 127-131, 2020.

[11] Q. D. Bui, "A pharmacophore model based on agonists and molecular docking on dopamine D2 receptor," (in Vietnamese), Journal of Military Pharmaco-medicine, vol. 49, no. 3, pp. 27-41, 2024.

[12] Schrödinger, QikProp User Manual 4.4. New York, 2015.

[13] Ministry of Health, Vietnamese National Drug Formulary. Hanoi: Medical Publshing House, (in Vietnamese), 2018.

[14] S. Office, British Pharmacopoeia 2018. Stationery Office, 2017.

[15] National Center for Biotechnology Information, "Rotigotine," August 2005. [Online]. Available: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/Rotigotine. [Accessed August 2024].

[16] T. Sommer, H. Hübner, A. E. Kerdawy, P. Gmeiner, M. Pischetsrieder, and T. Clark, "Identification of the Beer Component Hordenine as Food-Derived Dopamine D2 Receptor Agonist by Virtual Screening a 3D Compound Database," Sci. Rep., vol. 7, 2017, Art. no. 44201.

[17] S. Lei, "Cross interaction of dopaminergic and adrenergic systems in neural modulation," Int. J. Physiol. Pathophysiol. Pharmacol., vol. 6, no. 3, pp. 137-142, 2014.

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.11643

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ