XÁC ĐỊNH NHANH TẢI LƯỢNG GÂY BỆNH CỦA SRI LANKAN CASSAVA MOSAIC VIRUS TỪ HOM MÌ BỆNH TẠI MỘT SỐ KHU VỰC  TRÊN ĐỊA BÀN CÁC TỈNH MIỀN ĐÔNG NAM BỘ, VIỆT NAM  BẰNG PHƯƠNG PHÁP REAL–TIME PCR

Nguyễn Thành Luân; Nguyễn Thị Ngọc Châm; Phạm Văn Lộc; Trịnh Thị Hương

doi:10.34238/tnu-jst.12577

XÁC ĐỊNH NHANH TẢI LƯỢNG GÂY BỆNH CỦA SRI LANKAN CASSAVA MOSAIC VIRUS TỪ HOM MÌ BỆNH TẠI MỘT SỐ KHU VỰC TRÊN ĐỊA BÀN CÁC TỈNH MIỀN ĐÔNG NAM BỘ, VIỆT NAM BẰNG PHƯƠNG PHÁP REAL–TIME PCR

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 14/04/25 Ngày hoàn thiện: 25/08/25 Ngày đăng: 25/08/25

Các tác giả

1. Nguyễn Thành Luân , Trường Đại học Công Thương Thành phố Hồ Chí Minh
2. Nguyễn Thị Ngọc Châm, Trường Đại học Công Thương Thành phố Hồ Chí Minh
3. Phạm Văn Lộc, Trường Đại học Công Thương Thành phố Hồ Chí Minh
4. Trịnh Thị Hương, Trường Đại học Công Thương Thành phố Hồ Chí Minh

Tóm tắt

Chủng virus khảm lá sắn Sri Lanka là một chủng virus nguy hiểm, gây ra những ảnh hưởng nghiêm trọng đến năng suất và chất lượng cây sắn, đây là loại virus có đặc điểm lây lan rất nhanh và hiện nay chưa có thuốc đặc trị. Trong nghiên cứu này, các mẫu hom sắn có biểu hiện triệu chứng bị nhiễm virus được thu thập tại 04 địa điểm thuộc khu vực các tỉnh miền Đông Nam Bộ. Nghiên cứu đã sử dụng phương pháp CTAB – SDS để tách chiết thu hàm lượng ssDNA của virus. Đồng thời, phương pháp Real-Time PCR với cặp mồi đặc hiệu (5F/5R) được sử dụng để nhận diện sự biểu hiện của vùng protein AV1 và xác định nhanh tải lượng virus gây bệnh trên các mẫu nhiễm bệnh. Kết quả cho thấy, virus được phát hiện sau 22,6 chu kỳ (Ct) với nồng độ virus gây bệnh là 4,3 × 10³ IU/ml. Kết quả này mở ra triển vọng có thể đánh giá được nguy cơ gây bệnh của virus từ những giai đoạn sớm nhằm giảm thiểu rủi ro trong nền sản xuất nông nghiệp Việt Nam trong tương lai.

Từ khóa

Sri Lankan cassava mosaic virus; Hom sắn; Real–Time PCR; Protein AV1; Tải lượng virus

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

[1] H. N. Truong, N. M. Huynh, H. K. Le, T. C. Tran, T. N. Pham, K. Le, Q. A. Pham, and H. H. Nguyen, “Initial reseach on the presence of ssDNA Sri Lankan Cassava Mosaic Virus (SLCMV) on cassava (Manihot esculenta Crantz 1766),” HCMCOUJS- Engineering and Technology, vol. 17, no. 2, pp. 5-20, 2022.

[2] T. H. Pham, T. N. Q. Do, and A. V. Nguyen, “Initialsuccess on protoplast production from friable embryonic callus of Vietnamese cassava varieties,” Journal of Vietnam Agricultural Science and Technology, vol. 1, no. 122, pp. 26-35, 2021.

[3] T. T. Duong, T. P. N. Phan, T. T. H. Tran, T. T. H. La, T. H. D. Tran, and K. P. Le, “Study on in vitro micropropagation of cassava (manihot esculenta) to product the free-disease cassava plants,” HUAF Journal of Agricultural Science and Technology, vol. 7, no. 2, pp. 3588-3597, 2023.

[4] X. H. Trinh, Q. H. Ngo, M. H. Nguyen, and T. H. Le, “Some Studies on Using Cuttings for Management of Cassava Mosaic Virus Disease in Viet Nam,” Plant Protection, vol. 3, pp. 44-52, 2021.

[5] D. O. Igwe, C. B. Anyanwu, C. A. Afiukwa, C. V. Nnamani, F. N. Nweke, G. N. Ude, and B. E. Ubi, “Phenotypic and molecular screenings for determination of cassava mosaic disease (CMD) status in farmers’ felds in Ebonyi State, Nigeria,” Springer Nature, vol. 41, no. 1, pp. 227-240, 2020.

[6] S. Chaowongdee, N. Vannatim, S. Malichan, N. Kuncharoen, P. Tongyoo, and W. Siriwwan, “Comparative transcriptomics analysis reveals defense mechanisms of Manihot esculenta Crantz against Sri Lanka Cassava Mosaic Virus,” BMC Genomics, vol. 25, no. 436, pp. 1-17, 2024.

[7] L. Hanley-Bowdoin, E. R. Bejarano, D. Robertson, and S. Mansoor, “Geminiviruses: masters at redirecting and reprogramming plant processes,” Nat. Rev. Microbiol., vol. 11, no. 11, pp. 777-788, 2013.

[8] A. Celik, E. Orkun, M. Z. Yeken, V. Ciftici, G. Ozer, Y. Kim, F. S. Baloch, and Y. S. Chung, “A novel study on bean common mosaic virus accumulation shows disease resistance at the initial stage of infection in Phaseolus vulgaris,” Front. Genet., vol. 14, 2023, Art. no. 1136794.

[9] Q. Ali, I. B. Salisu, A. Raza, A. Shahid, A. Q. Rao, and T. Husnain, “A modified protocol for rapid DNA isolation from cotton (Gossypium spp.),” MethodsX, vol. 6, no. 2019, pp. 259-264, 2019.

[10] N. Minato, S. Sok, S. Chen, E. Delaquis, et al., “Surveillance for Sri Lankan cassava mosaic virus (SLCMV) in Cambodia and Vietnam one year after its initial detection in a single plantation in 2015,” PLoS One, vol. 14, no. 2, pp. 1-16, 2019, doi: 10.1371/journal.pone.0212780.

[11] A. Uke et al., “Detection of Sri Lankan cassava mosaic virus by loop-mediated isothermal amplification using dried reagents,” J. Virol Methods, vol. 299, no. 114336, pp. 1-23, 2022.

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.12577

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ