ĐẶC ĐIỂM PHÂN NHÓM PHÁT SINH LOÀI VÀ YẾU TỐ ĐỘC LỰC CỦA CHỦNG Escherichia coli TRONG NƯỚC THẢI BỆNH VIỆN TẠI CÁC TỈNH ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG

Ngô Thanh Phong; Đặng Văn Chính; Trần Đỗ Hùng; Huỳnh Xuân Phong

doi:10.34238/tnu-jst.13161

ĐẶC ĐIỂM PHÂN NHÓM PHÁT SINH LOÀI VÀ YẾU TỐ ĐỘC LỰC CỦA CHỦNG Escherichia coli TRONG NƯỚC THẢI BỆNH VIỆN TẠI CÁC TỈNH ĐỒNG BẰNG SÔNG CỬU LONG

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 01/07/25 Ngày hoàn thiện: 02/12/25 Ngày đăng: 03/12/25

Các tác giả

1. Ngô Thanh Phong, Viện Công nghệ Sinh học và Thực phẩm - Đại học Cần Thơ; Viện Y tế Công cộng Thành phố Hồ Chí Minh
2. Đặng Văn Chính, Viện Y tế Công cộng Thành phố Hồ Chí Minh
3. Trần Đỗ Hùng, Trường Đại học Y Dược Cần Thơ
4. Huỳnh Xuân Phong , Viện Công nghệ Sinh học và Thực phẩm - Đại học Cần Thơ

Tóm tắt

Nghiên cứu xác định đặc điểm phân nhóm phát sinh loài và các gene độc lực của vi khuẩn Escherichia coli phân lập từ nước thải bệnh viện tại các tỉnh ở Đồng bằng sông Cửu Long, Việt Nam. Tổng số 181 chủng E. coli được phân lập có 100 chủng được phân lập trong mẫu nước thải trước xử lý và 81 chủng từ mẫu sau xử lý. Phân nhóm phát sinh loài được xác định bằng phương pháp Quadruplex PCR, trong khi gene độc lực được phát hiện thông qua kỹ thuật PCR với 10 gene đặc trưng của các chủng E. coli gây bệnh đường ruột. Kết quả cho thấy nhóm phát sinh loài B1 và A chiếm ưu thế trong mẫu chưa xử lý, trong khi nhóm C chiếm ưu thế sau xử lý. Về gene độc lực, trong mẫu chưa xử lý chỉ phát hiện hai gene astA (4%) và daaD (9%). Sau xử lý, số lượng và loại gene độc lực được xác định bao gồm cả eaeA (6,17%), eagg (4,94%), astA (9,88%) và daaD (16,05%). Những kết quả này chỉ ra rằng, mặc dù xử lý nước thải giúp giảm số lượng vi khuẩn, nhưng vẫn còn tồn tại các chủng E. coli mang gene độc lực với nguy cơ phát tán ra môi trường, làm nổi bật nhu cầu cấp thiết cải tiến công nghệ xử lý nước thải tại bệnh viện.

Từ khóa

Phân nhóm phát sinh loài; Gen gây độc; Escherichia coli; Nước thải bệnh viện; Quadruplex PCR

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

[1] E. Liedhegner et al., “Similarities in virulence and extended spectrum beta-lactamase gene profiles among cefotaxime-resistant Escherichia coli wastewater and clinical isolates,” Antibiotics, vol. 11, no. 2, 2022, doi: 10.3390/antibiotics11020260.

[2] S. Badi et al., “Antibiotic resistance phenotypes and virulence-associated genes in Escherichia coli isolated from animals and animal food products in Tunisia,” FEMS Microbiol. Lett., vol. 365, no. 10, pp. 1–7, 2018, doi: 10.1093/femsle/fny088.

[3] J. B. Kaper et al., “Pathogenic Escherichia coli,” Nat. Rev. Microbiol., vol. 2, pp. 123–140, 2004, doi: 10.1038/nrmicro818.

[4] B. Naraghi et al., “Pathogenesis traits and antimicrobial resistance pattern in Escherichia coli isolates recovered from sewage,” Crescent J. Med. Biol. Sci., vol. 7, no. 4, pp. 488–496, 2020.

[5] O. Clermont et al., “Rapid and simple determination of the Escherichia coli phylogenetic group,” Appl. Environ. Microbiol., vol. 66, no. 10, pp. 4555–4558, 2000, doi: 10.1128/AEM.66.10.4555-4558.2000.

[6] O. Clermont et al., “The Clermont Escherichia coli phylo‐typing method revisited: improvement of specificity and detection of new phylo‐groups,” Environ. Microbiol. Rep., vol. 5, no. 1, pp. 58–65, 2013, doi: 10.1111/1758-2229.12019.

[7] J. Sarowska et al., “Virulence factors, prevalence and potential transmission of extraintestinal pathogenic Escherichia coli isolated from different sources: Recent reports,” Gut Pathog., vol. 11, no. 1, pp. 1–16, 2019, doi: 10.1186/s13099-019-0290-0.

[8] A. Bozorgomid et al., “Antibiotic resistance, virulence factors, and phylogenetic groups of Escherichia coli isolated from hospital wastewater: A case study in the west of Iran,” Environ. Heal. Eng. Manag., vol. 10, no. 2, pp. 131–139, 2023, doi: 10.34172/EHEM.2023.15.

[9] V. Saralaya et al., “Characterization of Escherichia coli phylogenetic groups associated with extraintestinal infections in South Indian population,” Ann. Med. Health Sci. Res., vol. 5, no. 4, pp. 241–246, 2015, doi: 10.4103/2141-9248.160192.

[10] A. Osińska et al., “The prevalence of virulence genes specific for Escherichia coli in wastewater samples from wastewater treatment plants with the activated sludge process,” E3S Web Conf., vol. 44, 2018, doi: 10.1051/e3sconf/20184400133.

[11] Vietnam Metrology Institute, “Vietnam National Standard 6187-1:2019 (ISO 9308-1:2014) - Water quality - Enumeration of Escherichia coli and coliform bacteria - Part 1: Membrane filtration method for waters with low bacterial background flora,” Ha Noi, Viet Nam, 2019.

[12] T. P. Ngo et al., “Antibiotic resistance genes, colistin‑resistant Escherichia coli, and physicochemicals in health care wastewater in Vinh Long General Hospital, Vietnam,” Environ. Monit. Assess., vol. 196, 2024, doi: 10.1007/s10661-024-13345-z.

[13] K . B. Omar et al., “Detection of diarrhoeagenic Escherichia coli in clinical and environmental water sources in South Africa using single-step 11-gene m-PCR,” World J. Microbiol. Biotechnol., vol. 30, no. 10, pp. 2663–2671, 2014, doi: 10.1007/s11274-014-1690-4.

[14] H. Salmani et al., “Pathotypic and phylogenetic study of diarrheagenic Escherichia coli and uropathogenic E . coli using multiplex polymerase chain r eaction,” Jundishapur J Microbiol., vol. 9, no. 2, pp. 1–7, 2016, doi: 10.5812/jjm.28331.

[15] A. Hinenoya et al., “Molecular characterization of cytolethal distending toxin gene-positive Escherichia coli from healthy cattle and swine in Nara, Japan,” BMC Microbiol., vol. 14, no. 97, pp. 1–13, 2014.

[16] M. A. Redha et al., “Virulence and phylogenetic groups of Escherichia coli cultured from raw sewage in Kuwait,” Gut Pathog., vol. 14, no. 1, 2022, Art. no. 18, doi: 10.1186/s13099-022-00490-4.

[17] V. Figueira et al., “Differential patterns of antimicrobial resistance in population subsets of Escherichia coli isolated from waste- and surface waters,” Sci. Total Environ., vol. 409, no. 6, pp. 1017–1023, 2011, doi: 10.1016/j.scitotenv.2010.12.011.

[18] G. Kumar et al., “Characterization and comparative analysis of antimicrobial resistance in Escherichia coli from hospital and municipal wastewater treatment plants,” J. Water Health, vol. 22, no. 12, pp. 2276–2288, 2024, doi: 10.2166/wh.2024.126.

[19] D. Iranpour et al., “Phylogenetic groups of Escherichia coli strains from patients with urinary tract infection in Iran based on the new Clermont phylotyping method,” Biomed Res. Int., vol. 2015, pp. 1–7, 2015, doi: 10.1155/2015/846219.

[20] Ministry of Natural Resources and Environment, “QCVN 28:2010/BTNMT - National technical regulation on health care wastewater,” Hanoi, Viet Nam, 2010.

[21] C. Jenkins et al., “Genotyping of enteroaggregative Escherichia coli and identification of target genes for the detection of both typical and atypical strains,” Diagn. Microbiol. Infect. Dis., vol. 55, no. 1, pp. 13–19, May 2006, doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2005.10.019.

[22] R. Mansan-Almeida et al., “Diffusely adherent Escherichia coli strains isolated from children and adults constitute two different populations,” BMC Microbiol., vol. 13, no. 1, 2013, Art. no. 22, doi: 10.1186/1471-2180-13-22.

[23] L. C. Spano et al., “High prevalence of diarrheagenic Escherichia coli carrying toxin-encoding genes isolated from children and adults in southeastern Brazil,” BMC Infect. Dis., vol. 17, no. 1, 2017, Art. no. 773, doi: 10.1186/s12879-017-2872-0.

[24] A. Almasi et al., “The frequency of entrotoxigenic E.coli in municipal and hospital wastewater treatment plants in west of Iran,” Int. J. Pharm. Technol., vol. 8, no. 4, pp. 22765–22772, 2016.

[25] J. Mbanga et al., “Antibiotic resistance, pathotypes, and pathogen-host interactions in Escherichia coli from hospital wastewater in Bulawayo, Zimbabwe,” PLoS One, vol. 18, no. 3, 2023, doi: 10.1371/journal.pone.0282273.

[26] Q. K. Tran et al., “Study on the infection rate of Escherichia coli strains and toxic genes in children with acute diarrhea in can tho using real-time PCR technique,” J. Med Res., vol. 175, no. 2, pp. 129–136, 2024, doi: 10.52852/tcncyh.v175i2.2270.

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.13161

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ