PHÂN TÍCH TẦN SỐ GEN KHÁNG KHÁNG SINH Ở SALMONELLA  VÀ SÀNG LỌC HỢP ỨC CHẾ KHÁNG KHÁNG SINH TIỀM NĂNG  BẰNG CÔNG CỤ SÀNG LỌC ẢO

Tạ Ngọc Ly; Đinh Thị Hoài

doi:10.34238/tnu-jst.6344

PHÂN TÍCH TẦN SỐ GEN KHÁNG KHÁNG SINH Ở SALMONELLA VÀ SÀNG LỌC HỢP ỨC CHẾ KHÁNG KHÁNG SINH TIỀM NĂNG BẰNG CÔNG CỤ SÀNG LỌC ẢO

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 09/08/22 Ngày hoàn thiện: 19/10/22 Ngày đăng: 21/10/22

Các tác giả

1. Tạ Ngọc Ly , Trường Đại học Bách khoa - ĐH Đà Nẵng
2. Đinh Thị Hoài, Trường Đại học Bách khoa - ĐH Đà Nẵng

Tóm tắt

Kháng kháng sinh là một mối quan tâm sức khỏe cộng đồng toàn cầu. Salmonella là một trong những vi sinh vật mà một số chủng huyết thanh kháng thuốc đã xuất hiện, ảnh hưởng đến chuỗi thức ăn. Do đó, nghiên cứu tìm ra các hợp chất mới có tiềm năng ức chế kháng kháng sinh là hết sức cần thiết. Nghiên cứu này nhằm xác định tần suất xuất hiện của gen kháng kháng sinh trong hệ gen Salmonella có nguồn gốc phân lập ở Việt Nam và sàng lọc các hợp chất có khả năng ức chế kháng kháng sinh. Sử dụng công cụ tin sinh học, kết quả phân tích cho thấy gen AAC(6') - Iaa có tần số xuất hiện cao nhất trong các mẫu nghiên cứu. Để sàng lọc ảo các hợp chất có hoạt tính sinh học có khả năng ức chế gen kháng kháng sinh này, các phương pháp lắp ráp phân tử và dự đoán đặc tính dược động học được sử dụng. Kết quả của quá trình sàng lọc đã tìm ra 4 hợp chất tiềm năng nhất bao gồm KU-0058684, AdipoRon, BPIPP và CID 3447933. Các hợp chất này có ái lực cao với protein đích, tính chất dược động học phù hợp để chế tạo thành thuốc, có thể được sử dụng làm hợp chất hàng đầu trong các nghiên cứu phát triển thuốc tiếp theo.

Từ khóa

ACC(6')-Iaa; Kháng kháng sinh; Tần suất; Salmonella; Sàng lọc ảo

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

[1] J. O.’ Neill, “Antimicrobial Resistance: Tackling a crisis for the health and wealth of nations The Review on Antimicrobial Resistance Chaired,” 2014. [Online]. Available: https://www.who.int/news/item/29-04-2019-new-report-calls-for-urgent-action-to-avert-antimicrobial-resistance-crisis. [Accessed Aug. 12, 2022].

[2] World Health Organization, “Antimicrobial resistance - global report on surveillance,” World Heal. Organ., vol. 61, no. 3, pp. 383-394, 2014.

[3] O. Ehuwa, A. K. Jaiswal, and S. Jaiswal, “Salmonella, Food Safety and Food Handling Practices,” Foods, vol. 10, no. 5, 2021, doi: 10.3390/foods10050907.

[4] S. E. Majowicz et al., “The global burden of nontyphoidal Salmonella gastroenteritis,” Clin. Infect. Dis. an Off. Publ. Infect. Dis. Soc. Am., vol. 50, no. 6, pp. 882-889, Mar. 2010, doi: 10.1086/650733.

[5] O. O. Ikhimiukor, E. E. Odih, P. Donado-Godoy, and I. N. Okeke, “A bottom-up view of antimicrobial resistance transmission in developing countries,” Nat. Microbiol., vol. 7, no. 6, pp. 757-765, 2022, doi: 10.1038/s41564-022-01124-w.

[6] Ł. Mąka and M. Popowska, “Antimicrobial resistance of Salmonella spp. isolated from food,” Rocz. Panstw. Zakl. Hig., vol. 67, no. 4, pp. 343-358, 2016.

[7] W. Deng et al., “Antibiotic Resistance in Salmonella from Retail Foods of Animal Origin and Its Association with Disinfectant and Heavy Metal Resistance,” Microb. Drug Resist., vol. 24, no. 6, pp. 782-791, 2018, doi: 10.1089/mdr.2017.0127.

[8] Y. Xu, X. Zhou, Z. Jiang, Y. Qi, A. Ed-Dra, and M. Yue, “Epidemiological Investigation and Antimicrobial Resistance Profiles of Salmonella Isolated From Breeder Chicken Hatcheries in Henan, China,” Front. Cell. Infect. Microbiol., vol. 10, p. 497, 2020, doi: 10.3389/fcimb.2020.00497.

[9] A. Z. Moe et al., “Prevalence and Antimicrobial Resistance of Salmonella Isolates from Chicken Carcasses in Retail Markets in Yangon, Myanmar,” J. Food Prot., vol. 80, no. 6, pp. 947-951, Jun. 2017, doi: 10.4315/0362-028X.JFP-16-407.

[10] X. Xia, “Bioinformatics and Drug Discovery,” Curr. Top. Med. Chem., vol. 17, no. 15, pp. 1709-1726, 2017, doi: 10.2174/1568026617666161116143440.

[11] N. L. Ta and T. A. T. Nguyen, “Identification of mpro potential inhibitors of Sars-Cov-2 from the database of Vietnam herb,” TNU J. Sci. Technol., vol. 227, no. 01, pp. 10-18, 2021, doi: 10.34238/tnu-jst.5206.

[12] J. J. Carrique-Mas et al., “Antimicrobial usage in chicken production in the Mekong Delta of Vietnam,” Zoonoses Public Health, vol. 62, Suppl 1, pp. 70-78, Apr. 2015, doi: 10.1111/zph.12165.

[13] Q. H. Luu, T. L. A. Nguyen, T. N. Pham, N. G. Vo, and P. Padungtod, “Antimicrobial use in household, semi-industrialized, and industrialized pig and poultry farms in Viet Nam,” Prev. Vet. Med., vol. 189, p. 105292, 2021, doi: 10.1016/j.prevetmed.2021.105292.

[14] A. B. Portes, G. Rodrigues, M. P. Leitão, R. Ferrari, C. A. Conte Junior, and P. Panzenhagen, “Global distribution of plasmid-mediated colistin resistance mcr gene in Salmonella: A systematic review,” J. Appl. Microbiol., vol. 132, no. 2, pp. 872-889, Feb. 2022, doi: 10.1111/jam.15282.

[15] K. L. Hopkins et al., “Multiresistant Salmonella enterica serovar 4,[5],12:i:- in Europe: a new pandemic strain?,” Euro Surveill. Bull. Eur. sur les Mal. Transm. = Eur. Commun. Dis. Bull., vol. 15, no. 22, p. 19580, Jun. 2010.

[16] C. Lucarelli et al., “Evidence for a second genomic island conferring multidrug resistance in a clonal group of strains of Salmonella enterica serovar Typhimurium and its monophasic variant circulating in Italy, Denmark, and the United Kingdom,” J. Clin. Microbiol., vol. 48, no. 6, pp. 2103-2109, Jun. 2010, doi: 10.1128/JCM.01371-09.

[17] Ł. Mąka, E. Maćkiw, H. Ścieżyńska, M. Modzelewska, and M. Popowska, “Resistance to Sulfonamides and Dissemination of sul Genes Among Salmonella spp. Isolated from Food in Poland,” Foodborne Pathog. Dis., vol. 12, no. 5, pp. 383-389, May 2015, doi: 10.1089/fpd.2014.1825.

[18] A. Arnott et al., “Multidrug-Resistant Salmonella enterica 4,[5],12:i:- Sequence Type 34, New South Wales, Australia, 2016-2017,” Emerg. Infect. Dis., vol. 24, no. 4, pp. 751-753, Apr. 2018, doi: 10.3201/eid2404.171619.

[19] I. Rodríguez, S. Jahn, A. Schroeter, B. Malorny, R. Helmuth, and B. Guerra, “Extended-spectrum β-lactamases in German isolates belonging to the emerging monophasic Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium 4,[5],12:i:- European clone.,” The Journal of antimicrobial chemotherapy, vol. 67, no. 2, pp. 505-508, Feb. 2012, doi: 10.1093/jac/dkr452.

[20] D. Berdejo, N. Merino, E. Pagán, D. García-Gonzalo, and R. Pagán, “Genetic variants and phenotypic characteristics of salmonella typhimurium-resistant mutants after exposure to carvacrol,” Microorganisms, vol. 8, no. 6, pp. 1-22, 2020, doi: 10.3390/microorganisms8060937.

[21] E. A. McMillan et al., “Antimicrobial Resistance Genes, Cassettes, and Plasmids Present in Salmonella enterica Associated With United States Food Animals,” Front. Microbiol., vol. 10, p. 832, 2019, doi: 10.3389/fmicb.2019.00832.

[22] M. B. Sadiq, J. Tarning, T. Z. Aye Cho, and A. K. Anal, “Antibacterial Activities and Possible Modes of Action of Acacia nilotica (L.) Del. against Multidrug-Resistant Escherichia coli and Salmonella,” Molecules, vol. 22, no. 1, Jan. 2017, doi: 10.3390/molecules22010047.

[23] P. G. Vital, M. B. D. Caballes, and W. L. Rivera, “Antimicrobial resistance in Escherichia coli and Salmonella spp. isolates from fresh produce and the impact to food safety,” J. Environ. Sci. Heal. Part. B, Pestic. food Contam. Agric. wastes, vol. 52, no. 9, pp. 683-689, Sep. 2017, doi: 10.1080/03601234.2017.1331676.

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.6344

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ