Chia sẻ bài báo qua Email TỔNG QUAN VỀ CÁC PHƯƠNG PHÁP PHÂN LẬP, ĐỊNH DANH VI KHUẨN GÂY BỆNH ĐƯỜNG RUỘT MỚI NỔI Escherichia albertii
Thông tin bài báo
Ngày nhận bài: 25/05/23 Ngày hoàn thiện: 25/07/23 Ngày đăng: 28/07/23Các tác giả
Nguyễn Thị Thu Hương
, Trường Đại học Nông Lâm – ĐH Thái Nguyên
Tóm tắt
Escherichia albertii là vi khuẩn gây tiêu chảy mới nổi, lây truyền qua thực phẩm và nước uống bị nhiễm khuẩn. Vi khuẩn này có quan hệ thân thuộc và thường bị định danh nhầm là E. coli do sự giống nhau về các đặc điểm hoá sinh và di truyền. Do chưa có một quy trình phân lập và định danh được tiêu chuẩn hoá nên tầm quan trọng dịch tễ của E. albertii có thể bị đánh giá thấp do phân loại nhầm, không những với E. coli mà còn các Enterobacteriaceae khác. Khai thác các kiểu hình như không có khả năng lên men rhamnose, xylose và các xét nghiệm PCR xác định gene đặc hiệu của E. albertii có thể xác định chính xác mầm bệnh này. Tuy nhiên, phát triển các công cụ chẩn đoán đơn giản và hiệu quả để có thể sử dụng rộng rãi cho các phòng thí nghiệm thông thường là cần thiết để có thể hỗ trợ kiểm soát dịch tễ tốt hơn đối với vi khuẩn mới nổi khó định danh này.
Từ khóa
Toàn văn:
PDFTài liệu tham khảo
[1] G. Huys, M. Cnockaert, J. M. Janda, and J. Swings, "Escherichia albertii sp. nov., a diarrhoeagenic species isolated from stool specimens of Bangladeshi children," International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, vol. 53, no. 3, pp. 807-810, 2003, doi: 10.1099/ijs.0.02475-0.
[2] T. A. T. Gomes, T. Ooka, R. T. Hernandes, D. Yamamoto, and T. Hayashi, "Escherichia albertii pathogenesis," EcoSal Plus, vol. 9, no. 1, 2020, doi: 10.1128/ecosalplus.esp-0015-2019.
[3] T. J. Inglis, A. J. Merritt, N. Bzdyl, S. Lansley, and M. N. Urosevic, "First bacteraemic human infection with Escherichia albertii," New Microbes and New Infection, vol. 8, pp. 171-173, Nov 2015, doi: 10.1016/j.nmni.2015.07.003.
[4] T. Ooka, K. Seto, K. Kawano, H. Kobayashi, Y. Etoh, S. Ichihara et al., "Human gastroenteritis outbreak associated with Escherichia albertii, Japan," Emerging Infectious Diseases, vol. 19, no. 1, pp. 144-1446, 2013, doi: 10.3201/eid1901.120646.
[5] T. Konno, J. Yatsuyanagi, S. Takahashi, Y. Kumagai, E. Wada, M. Chiba, and S. Saito, "Isolation and identification of Escherichia albertii from a patient in an outbreak of gastroenteritis," Japanese Journal of Infectious Diseases, vol. 65, no. 3, pp. 203-207, 2012.
[6] N. Asoshima, M. Matsuda, K. Shigemura, M. Honda, H. Yoshida, H. Hiwaki, K. Ogata, and T. Oda, "Identification of Escherichia albertii as a causative agent of a food-borne outbreak occurred in 2003," Japanese Journal of Infectious Diseases, vol. 67, no. 2, pp. 139-140, 2014, doi: 10.7883/yoken.67.139.
[7] K. Masuda, T. Ooka, H. Akita, T. Hiratsuka, S. Takao, M. Fukada, K. Inoue, M. Honda, J. Toda, and W. Sugitani, "Epidemiological aspects of Escherichia albertii outbreaks in Japan and genetic characteristics of the causative pathogen," Foodborne Pathogens and Disease, vol. 17, no. 2, pp. 144-150, 2020, doi: 10.1089/fpd.2019.2654.
[8] E. Tokuoka, K. Furukawa, T. Nagamura, F. Harada, K. Ekinaga, and H. Tokunaga, "Food poisoning outbreak due to atypical EPEC OUT: HNM, May 2011–Kumamoto," Infect Agents Surveillance Report, vol. 33, pp. 8-9, 2012.
[9] T. Ooka, K. Seto, K. Kawano, H. Kobayashi, Y. Etoh, S. Ichihara, A. Kaneko, J. Isobe, K. Yamaguchi, K. Horikawa, T. A. T. Gomes, A. Linden, M. Bardiau, J. G. Mainil, L. Beutin, Y. Ogura, and T. Hayashi, "Clinical significance of Escherichia albertii," Emerging Infectious Diseases, vol. 18, no. 3, pp. 488-492, 2012, doi: 10.3201/eid1803.111401.
[10] K. Murakami, K. Murakami, Y. Etoh, E. Tanaka, S. Ichihara, K. Horikawa, K. Kawano, T. Ooka, Y. Kawamura, and K. Ito, "Shiga toxin 2f-producing Escherichia albertii from a symptomatic human," Japanese Journal of Infectious Diseases, vol. 67, no. 3, pp. 204-208, 2014, doi: 10.7883/yoken.67.204.
[11] S. L. Abbott, J. O'Connor, T. Robin, B. L. Zimmer, and J. M. Janda, "Biochemical properties of a newly described Escherichia species, Escherichia albertii," Journal of Clinical Microbiology, vol. 41, no. 10, pp. 4852-4854, 2003, doi: 10.1128/jcm.41.10.4852-4854.2003.
[12] L. F. Nimri, "Escherichia albertii, a newly emerging enteric pathogen with poorly defined properties," Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, vol. 77, no. 2, pp. 91-95, 2013, doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2013.06.028.
[13] T. Ooka, Y. Ogura, K. Katsura, K. Seto, H. Kobayashi, K. Kawano, E. Tokuoka, M. Furukawa, S. Harada, S. Yoshino, J. Seto, T. Ikeda, K. Yamaguchi, K. Murase, Y. Gotoh, N. Imuta, J. Nishi, T. A. Gomes, L. Beutin, and T. Hayashi, "Defining the genome features of Escherichia albertii, an emerging enteropathogen closely related to Escherichia coli," Genome Biology and Evolution, vol. 7, no. 12, pp. 3170-3179, 2015, doi: 10.1093/gbe/evv211.
[14] K. Murakami E. Maeda-Mitani, H. Kimura, M. Honda, T. Ikeda, W. Sugitani, T. Konno, K. Kawano, Y. Etoh, N. Sera, F. Mizukoshi, T. Saitoh, Y. Kawamura, T. Ishioka, M. Ohnishi, K. Oishi, and S. Fujimoto, "Non-biogroup 1 or 2 strains of the emerging zoonotic pathogen Escherichia albertii, their proposed assignment to biogroup 3, and their commonly detected characteristics," Frontiers in Microbiology, vol. 10, p. 1543, 2019, doi: 10.3389/fmicb.2019.01543.
[15] A. Hinenoya, H. Ichimura, S. P. Awasthi, N. Yasuda, J. Yatsuyanagi, and S. Yamasaki, "Phenotypic and molecular characterization of Escherichia albertii: further surrogates to avoid potential laboratory misidentification," International Journal of Medical Microbiology, vol. 309, no. 2, pp. 108-115, 2019, doi: 10.1016/j.ijmm.2018.12.003.
[16] A. F. Maheux, S. Brodeur, È. Bérubé, D. K. Boudreau, J. Y. Abed, M. Boissinot, L. Bissonnette, and M. G. Bergeron, "Method for isolation of both lactose-fermenting and – non-fermenting Escherichia albertii strains from stool samples," Journal of Microbiology Methods, vol. 154, pp. 134-140, 2018, doi: 10.1016/j.mimet.2018.09.008.
[17] S. Arai, K. Ohtsuka, N. Konishi, K. Ohya, T. Konno, Y. Tokoi, H. Nagaoka, Y. Asano, H. Maruyama, and H. Uchiyama, "Evaluating methods for detecting Escherichia albertii in chicken meat," Journal of Food Protection, vol. 84, no. 4, pp. 553-562, 2021, doi: 10.4315/JFP-20-206.
[18] I. Stock, M. Rahman, K. J. Sherwood, and B. Wiedemann, "Natural antimicrobial susceptibility patterns and biochemical identification of Escherichia albertii and Hafnia alvei strains," Diagnostic Microbiology and Infectious Diseases, vol. 51, no. 3, pp. 151-163, 2005, doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2004.10.008.
[19] J. M. Janda, S. L. Abbott, and M. J. Albert, "Prototypal diarrheagenic strains of Hafnia alvei are actually members of the genus Escherichia," Journal of Clinical Microbiology, vol. 37, no. 8, pp. 2399-2401, 1999, doi: 10.1128/JCM.37.8.2399-2401.1999.
[20] L. Luo, H. Wang, M. J. Payne, C. Liang, L. Bai, H. Zheng, Z. Zhang, L. Zhang, X. Zhang, G. Yan, N. Zou, X. Chen, Z. Wan, Y. Xiong, R. Lan, and Q. Li, "Comparative genomics of Chinese and international isolates of Escherichia albertii: population structure and evolution of virulence and antimicrobial resistance," Microbial Genomics, vol. 7, no. 12, 2021, doi: 10.1099/mgen.0.000710.
[21] R. L. Lindsey, L. Garcia-Toledo, D. Fasulo, L. M. Gladney, and N. Strockbine, "Multiplex polymerase chain reaction for identification of Escherichia coli, Escherichia albertii and Escherichia fergusonii," Journal of Microbiology Methods, vol. 140, pp. 1-4, 2017, doi: 10.1016/j.mimet.2017.06.005.
[22] S. Arai, S. Yamaya, K. Ohtsuka, N. Konishi, H. Obata, T. Ooka, S. Hirose, A. Kai, and Y. Hara-Kudo, "Detection of Escherichia albertii in Retail Oysters," Journal of Food Protection, vol. 85, no. 1, pp. 173-179, 2022, doi: 10.4315/jfp-21-222.
[23] Y. Wakabayashi, K. Seto, M. Kanki, T. Harada, and K. Kawatsu, "Proposal of a novel selective enrichment broth, NCT-mTSB, for isolation of Escherichia albertii from poultry samples," Journal of Applied Microbiology, vol. 132, no. 3, pp. 2121-2130, 2022, doi: 10.1111/jam.15353.
[24] H. Wang, Q. Li, X. Bai, Y. Xu, A. Zhao, H. Sun, J. Deng, B. Xiao, X. Liu, and S. Sun, "Prevalence of eae-positive, lactose non-fermenting Escherichia albertii from retail raw meat in China," Epidemiology and Infection, vol. 144, no. 1, pp. 45-52, 2016, doi: 10.1017/S0950268815001120.
[25] A. Hinenoya, K. Nagano, S. P. Awasthi, N. Hatanaka, and S. Yamasaki, "Prevalence of Escherichia albertii in raccoons (Procyon lotor), Japan," Emerging Infectious Diseases, vol. 26, no. 6, p. 1304, 2020, doi: 10.3201/eid2606.191436.
[26] A. Hinenoya, X. P. Li, X. Zeng, O. Sahin, R. A. Moxley, C. M. Logue, B. Gillespie, S. Yamasaki, and J. Lin, "Isolation and characterization of Escherichia albertii in poultry at the pre‐harvest level," Zoonoses and Public Health, vol. 68, no. 3, pp. 213-225, 2021, doi: 10.1111/zph.12812.
[27] A. Hinenoya, K. Nagano, K. Okuno, A. Nagita, N. Hatanaka, S. P. Awasthi, and S. Yamasaki, "Development of XRM-MacConkey agar selective medium for the isolation of Escherichia albertii," Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, vol. 97, no. 1, 2020, doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2020.115006.
[28] K. E. Hyma, D. W. Lacher, A. M. Nelson, A. C. Bumbaugh, J. M. Janda, N. A. Strockbine, V. B. Young, and T. S. Whittam, "Evolutionary genetics of a new pathogenic Escherichia species: Escherichia albertii and related Shigella boydii strains," Journal of Bacteriology, vol. 187, no. 2, pp. 619-28, 2005, doi: 10.1128/jb.187.2.619-628.2005.
[29] A. Hinenoya, H. Ichimura, N. Yasuda, S. Harada, K. Yamada, M. Suzuki, Y. Iijima, A. Nagita, M. J. Albert, N. Hatanaka, S. P. Awasthi, and S. Yamasaki, "Development of a specific cytolethal distending toxin (cdt) gene (Eacdt)–based PCR assay for the detection of Escherichia albertii," Diagnostic Microbiology and Infectious Disease, vol. 95, no. 2, pp. 119-124, 2019, doi: 10.1016/j.diagmicrobio.2019.04.018.
[30] J. L. Oaks, T. E. Besser, S. T. Walk, D. M. Gordon, K. B. Beckmen, K. A. Burek, G. J. Haldorson, D. S. Bradway, L. Ouellette, F. R. Rurangirwa, M. A. Davis, G. Dobbin, and T. S. Whittam, "Escherichia albertii in wild and domestic birds," Emerging Infectious Dieases, vol. 16, no. 4, pp. 638-46, 2010, doi: 10.3201/eid1604.090695.
[31] A. F. Maheux, D. K. Boudreau, M. G. Bergeron, and M. J. Rodriguez, "Characterization of Escherichia fergusonii and Escherichia albertii isolated from water," Journal of Applied Microbiology, vol. 117, no. 2, pp. 597-609, 2014, doi: 10.1111/jam.12551.
[32] R. Stenutz, A. Weintraub, and G. Widmalm, "The structures of Escherichia coli O-polysaccharide antigens," FEMS Microbiol Review, vol. 30, no. 3, pp. 382-403, 2006, doi: 10.1111/j.1574-6976.2006.00016.x.
[33] B. Liu, Y. A. Knirel, L. Feng, A. V. Perepelov, S. N. Senchenkova, P. R. Reeves, and L. Wang, "Structural diversity in Salmonella O antigens and its genetic basis," FEMS Microbiology Review, vol. 38, no. 1, pp. 56-89, 2014, doi: 10.1111/1574-6976.12034.
[34] B. Liu, Y. A. Knirel, L. Feng, A. V. Perepelov, S. N. Senchenkova, Q. Wang, P. R. Reeves, and L. Wang, "Structure and genetics of Shigella O antigens," FEMS Microbiol Review, vol. 32, no. 4, pp. 627-53, 2008, doi: 10.1111/j.1574-6976.2008.00114.x.
[35] M. Z. Rahman, S. Akter, N. Azmuda, M. Sultana, F. X. Weill, S. I. Khan, P. A. Grimont, and N. K. Birkeland, "Serological cross-reaction between O-antigens of Shigella dysenteriae type 4 and an environmental Escherichia albertii isolate," Current Microbiology, vol. 67, no. 5, pp. 590-595, 2013, doi: 10.1007/s00284-013-0405-7.
[36] H. Zheng, O. I. Naumenko, H. Wang, Y. Xiong, J. Wang, A. S. Shashkov, Q. Li, and Y. A. Knirel, "Colitose-containing O-polysaccharide structure and O-antigen gene cluster of Escherichia albertii HK18069 related to those of Escherichia coli O55 and E. coli O128," Carbohydrate Research, vol. 480, pp. 73-79, 2019, doi: 10.1016/j.carres.2019.05.013.
[37] O. I. Naumenko, H. Zheng, S. N. Senchenkova, H. Wang, Q. Li, A. S. Shashkov, J. Wang, Y. A. Knirel, and Y. Xiong, "Structures and gene clusters of the O-antigens of Escherichia albertii O3, O4, O6, and O7," Carbohydrate Research, vol. 449, pp. 17-22, 2017, doi: 10.1016/j.carres.2017.06.008.
[38] T. Ooka, K. Seto, Y. Ogura, K. Nakamura, A. Iguchi, Y. Gotoh, M. Honda, Y. Etoh, T. Ikeda, W. Sugitani, T. Konno, K. Kawano, N. Imuta, K. Yoshiie, Y. Hara-Kudo, K. Murakami, T. Hayashi, and J. Nishi, "O-antigen biosynthesis gene clusters of Escherichia albertii: their diversity and similarity to Escherichia coli gene clusters and the development of an O-genotyping method," Microbial Genomics, vol. 5, no. 11, 2019, doi: 10.1099/mgen.0.000314.
[39] H. Wang, H. Zheng, Q. Li, Y. Xu, J. Wang, P. Du, X. Li, X. Liu, L. Zhang, N. Zou, G. Yan, Z. Zhang, H. Jing, J. Xu, and Y. Xiong, "Defining the genetic features of O-antigen biosynthesis gene cluster and performance of an O-antigen serotyping scheme for Escherichia albertii," Frontiers in Microbiology, vol. 8, 2017, doi: 10.3389/fmicb.2017.01857.
[40] K. Nakae, T. Ooka, K. Murakami, Y. Hara-Kudo, N. Imuta, Y. Gotoh, Y. Ogura, T. Hayashi, Y. Okamoto, and J. Nishi, "Diversification of Escherichia albertii H-antigens and development of H-genotyping PCR," Frontiers in Microbiology, vol. 12, 2021, doi: 10.3389/fmicb.2021.737979.
[41] C. Luo, S. T. Walk, D. M. Gordon, M. Feldgarden, J. M. Tiedje, and K. T. Konstantinidis, "Genome sequencing of environmental Escherichia coli expands understanding of the ecology and speciation of the model bacterial species," Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 108, no. 17, pp. 7200-7205, 2011, doi: 10.1073/pnas.1015622108.DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.8019
Các bài báo tham chiếu
- Hiện tại không có bài báo tham chiếu