NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM VÙNG GEN 18S rRNA, GEN rbcL  VÀ MỐI QUAN HỆ PHÁT SINH LOÀI CỦA CÂY BẢY LÁ MỘT HOA  (Paris vietnamensis) THU TẠI YÊN BÁI

Cao Bá Cường; Nguyễn Văn Trữ; La Việt Hồng

doi:10.34238/tnu-jst.8289

NGHIÊN CỨU ĐẶC ĐIỂM VÙNG GEN 18S rRNA, GEN rbcL VÀ MỐI QUAN HỆ PHÁT SINH LOÀI CỦA CÂY BẢY LÁ MỘT HOA (Paris vietnamensis) THU TẠI YÊN BÁI

Thông tin bài báo

Ngày nhận bài: 06/07/23 Ngày hoàn thiện: 17/10/23 Ngày đăng: 18/10/23

Các tác giả

1. Cao Bá Cường , Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2
2. Nguyễn Văn Trữ, Viện Công nghệ Sinh học - Viện Hàn lâm Khoa học & Công nghệ Việt Nam
3. La Việt Hồng, Trường Đại học Sư phạm Hà Nội 2

Tóm tắt

Cây bảy lá một hoa (Paris vietnamensis) là một trong những loại dược liệu quan trọng được sử dụng trong y học truyền thống. Trong nghiên cứu, vùng gen 18S rRNA và rbcL của cây bảy lá một hoa thu tại Yên Bái được phân lập, giải trình tự và phân tích đặc điểm. Hơn nữa, nghiên cứu cũng đánh giá khả năng sử dụng 18S rRNA và rbcL để phân loại, định danh và sự phát sinh loài. Kết quả cho thấy kích thước của 18S rRNA và rbcL lần lượt là 973 bp và 563 bp; hàm lượng GC của hai vùng gen này lần lượt là 50,98 (%) và 44,23 (%). Phân tích bằng chương trình BLAST với các trình tự 18S rRNA và rbcL đã công bố của chi Paris cho thấy vùng gen 18S rRNA của nghiên cứu này có độ tương đồng cao từ 99,08 đến 99,28%, chứa hai trình tự bảo tồn cao đó là từ vị trí 84 đến vị trí 604 và từ vị trí 606 đến vị trí 871. Gen rbcL có độ tương đồng cao (99,82%) so với các trình tự rbcL của một số loài thuộc chi Paris đã công bố. Vùng gene 18S rRNA có thể là ứng viên mã vạch DNA tiềm năng trong hỗ trợ việc phân loại, định danh ở mức độ loài, trong khi gen rbcL có thể hỗ trợ phân loại, định danh ở mức độ chi.

Từ khóa

Bảy lá một hoa; Đặc điểm; 18S rRNA; Vùng gen rbcL; Yên Bái

Toàn văn:

PDF

Tài liệu tham khảo

lang=PT-BR style='font-family:"Times New Roman",serif;color:black;mso-themecolor:

text1;mso-ansi-language:PT-BR'>

style='mso-spacerun:yes'> ADDIN EN.REFLIST

field-separator'>

[1] D. T. Vu, A. N. Cao, H. T. T. Tran, T. T. Nguyen, T. H. Nguyen, D. T. Nguyen, and H. T. Do, "Pharmacognostic documentation of the plant Paris polyphylla var. chinensis (Franchet) H. Hara (Trilliaceae) of Vietnam," Pharmacology journal, vol. 58, no. 4, pp. 63-67, 2018.

[2] Y.-G. Ding, Y.-L. Zhao, J. Zhang, Z.-T. Zuo, Q.-Z. Zhang, and Y.-Z. Wang, "The traditional uses, phytochemistry, and pharmacological properties of Paris L. (Liliaceae): A review," Journal of Ethnopharmacology, vol. 278, 2021, Art. no. 114293.

[3] N. Q. Nguyen, H. T. Pham, T. V. Pham, and T. V. Hoang, "Taxonomy of the genus Paris L. (Melanthiaceae) in Vietnam," Academia Journal of Biology, vol. 38, no. 3, pp. 333-339, 2016.

[4] S. Ruchisansakun, S. Sraphet, C. Yothawut, C. Thamanukornsri, N. Suksee, et al., "Revision on the Genus Paris in Thailand, with a New Species Paris siamensis," Plants, vol. 12, no. 3, p. 430, 2023.

[5] P. Mishra, A. Kumar, A. Nagireddy, D. N. Mani, A. K. Shukla, R. Tiwari, and V. Sundaresan, "DNA barcoding: an efficient tool to overcome authentication challenges in the herbal market," Plant Biotechnol J, vol. 14, no. 1, pp. 8-21, Jan 2016.

[6] P. Mishra, A. Kumar, A. Nagireddy, A. K. Shukla, and V. Sundaresan, "Evaluation of single and multilocus DNA barcodes towards species delineation in complex tree genus Terminalia," PLoS One, vol. 12, no. 8, 2017, Art. no. e0182836.

[7] Y.-j. Zhu, S. L. Chen, H. Yao, R. Tan, J. Y. Song, K. Luo, and J. Lu, "DNA barcoding the medicinal plants of the genus Paris," Acta pharmaceutica Sinica, vol. 45, no. 3, pp. 376-382, 2010.

[8] D. T. Nguyen. N. Q. Nguyen, L. N. Tran, T. T. Nguyen, P. T. Ninh, N. T. T. Doan, H. T. T. Le, and L. N. Nguyen, "Morphological Characteristics and DNA Barcodes of Paris vietnamensis (Takht.) H.Li in Vietnam," Vietnam J. Agri. Sci., vol. 16, no. 4, pp. 282-289, 2018.

[9] L. N. T. Nguyen, Q. H. Nguyen, T. T.T. Vu, and M. H. Chu, "Identification of three species, Paris fargesii, Paris polyphylla, Paris vietnamensis collected in Viet Nam and phylogenetic inference in the genus Paris," TNU Journal of Science and Technology, vol. 225, no. 08, pp. 395-402, 2020.

[10] J. Doyle, "DNA Protocols for Plants," in Molecular Techniques in Taxonomy, G. M. Hewitt, A. W. B. Johnston, and J. P. W. Young, Eds. Berlin, Heidelberg: Springer Berlin Heidelberg, 1991, pp. 283-293.

[11] T. Hall, "BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT.," Nucl. Acids. Symp., vol. 41, pp. 95-98, 1999.

[12] S. Kumar, G. Stecher, M. Li, C. Knyaz, and K. Tamura, "MEGA X: Molecular Evolutionary Genetics Analysis across Computing Platforms," Molecular biology and evolution, vol. 35, pp. 1547-1549, 2018.

[13] T. T. T. Vu, L. T. K. Vu, L. T. Le, T. T. M. Lo, M. H. Chu, "Analysis of the Chloroplast Genome of Ficus simplicissima Lour Collected in Vietnam and Proposed Barcodes for Identifying Ficus Plants," Curr. Issues Mol. Biol., vol. 45, no. 2, pp. 1024-1036, 2023.

115%;font-family:"Times New Roman",serif;mso-fareast-font-family:Calibri;

mso-fareast-theme-font:minor-latin;color:black;mso-themecolor:text1;mso-ansi-language:

PT-BR;mso-fareast-language:EN-US;mso-bidi-language:AR-SA;mso-no-proof:yes'>

style='mso-element:field-end'>

DOI: https://doi.org/10.34238/tnu-jst.8289

Các bài báo tham chiếu

Hiện tại không có bài báo tham chiếu



Ghi nhớ